KI-Revolution: Genomikforschung neu definiert durch große Sprachmodelle

Lesezeit: 2 Minuten
Durch Hans Meier
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KI-Algorithmen, die DNA-Stränge mit leuchtenden Schaltkreisen analysieren.

BerlinKünstliche Intelligenz macht rasante Fortschritte in der Genomforschung. An der Universität von Kalifornien in der medizinischen Fakultät von San Diego haben Forscher gezeigt, dass große Sprachmodelle wie GPT-4 dabei helfen können, Aufgaben in der funktionalen Genomik zu automatisieren. Dieses Forschungsgebiet befasst sich mit dem Verständnis der Funktionen von Genen und ihrer Wechselwirkungen, was traditionell als schwierig und zeitaufwendig galt. Große Sprachmodelle bieten eine neue Möglichkeit, Gen-Sets zu analysieren, und könnten die Arbeitsweise von Wissenschaftlern in diesem Bereich revolutionieren.

Gensatzanreicherung ist eine gängige Methode in der funktionalen Genomik, bei der Forscher Gruppen von Genen mit Datenbanken vergleichen, um deren Funktionen besser zu verstehen. Allerdings decken vorhandene Datenbanken nicht immer alle Bereiche der Biologie ab, was zu Wissenslücken führen kann. Künstliche Intelligenz kann helfen, diese Lücken zu schließen. In einer Studie mit fünf großen Sprachmodellen schnitt GPT-4 am besten ab. Es erzielte eine Genauigkeitsrate von 73 % bei der Identifizierung von Genfunktionen und vermied es in 87 % der Fälle, bei zufälligen Genmengen zu raten, wodurch die Wahrscheinlichkeit falscher Informationen reduziert wurde.

KI bringt spannende Vorteile für die Erforschung von Genen und DNA mit sich, indem sie die Entschlüsselung komplexer Informationen vereinfachen und beschleunigen kann.

Effizienz: Verkürzt die benötigte Zeit für die Datenanalyse erheblich. Genauigkeit: Liefert präzise Analysen von Genfunktionen mit minimalen Fehlern. Skalierbarkeit: Kann größere Datensätze effizienter als traditionelle Methoden verarbeiten. Innovation: Fördert neue, bisher unerforschte Hypothesen.

Diese Fähigkeiten markieren eine signifikante Veränderung in der Durchführung von Genomik-Studien. Durch die Automatisierung der Analyse von Gen-Sets können Wissenschaftler mehr Zeit in die Planung von Experimenten und die Umsetzung ihrer Forschungsergebnisse investieren. Mit fortschreitender Technologie könnten große Sprachmodelle maßgeschneiderte Einblicke bieten, die zu neuen Fortschritten in der Präzisionsmedizin führen.

Die Universität von Kalifornien in San Diego hat eine Webseite entwickelt, um Forschern die Nutzung von großen Sprachmodellen in ihren Projekten zu erleichtern. Dieses Vorhaben ist Teil eines umfassenderen Ziels, die Zusammenarbeit in der Wissenschaft zu fördern. Dadurch können Forscher leichter miteinander in Kontakt treten, schneller Entdeckungen machen und ihre Methoden austauschen.

Künstliche Intelligenz in der Genomik geht über die Datenverarbeitung hinaus; sie kann auch neue Forschungsansätze rasch entwickeln und dadurch schnellere Durchbrüche ermöglichen. Mit fortschreitender Verbesserung der KI könnte sich die Genomikforschung grundlegend verändern, indem sie Technologie und Biologie zusammenbringt, um das Leben besser zu verstehen.

Die Studie wird hier veröffentlicht:

http://dx.doi.org/10.1038/s41592-024-02525-x

und seine offizielle Zitation - einschließlich Autoren und Zeitschrift - lautet

Mengzhou Hu, Sahar Alkhairy, Ingoo Lee, Rudolf T. Pillich, Dylan Fong, Kevin Smith, Robin Bachelder, Trey Ideker, Dexter Pratt. Evaluation of large language models for discovery of gene set function. Nature Methods, 2024; DOI: 10.1038/s41592-024-02525-x
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