Revolución en la investigación genómica: IA y modelos de lenguaje impulsan nuevos descubrimientos

Tiempo de lectura: 2 minutos
Por Juanita Lopez
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Algoritmos de IA analizando cadenas de ADN con circuitos brillantes.

MadridLa inteligencia artificial está progresando rápidamente en la investigación genómica. En la Escuela de Medicina de la Universidad de California en San Diego, los investigadores han demostrado que los modelos de lenguaje grandes, como GPT-4, pueden ayudar a automatizar tareas en genómica funcional. Este campo de estudio se centra en entender para qué sirven los genes y cómo interactúan, lo cual ha sido tradicionalmente complicado y lento. Los modelos de lenguaje grandes ofrecen una nueva forma de analizar conjuntos de genes, con el potencial de transformar la labor de los científicos en esta área.

El enriquecimiento de conjuntos de genes es un método popular en la genómica funcional, donde los investigadores comparan grupos de genes con bases de datos para comprender mejor sus funciones. No obstante, las bases de datos existentes no siempre cubren todos los aspectos de la biología, lo que genera lagunas en el conocimiento. La inteligencia artificial puede ayudar a cubrir estas lagunas. En un estudio sobre cinco grandes modelos de lenguaje, GPT-4 fue el mejor, alcanzando un 73% de precisión al identificar funciones genéticas y evitó suposiciones en el 87% de las pruebas con conjuntos de genes aleatorios, lo cual disminuye la posibilidad de información incorrecta.

La inteligencia artificial ofrece numerosos beneficios emocionantes para el estudio de los genes y el ADN, facilitando y acelerando la comprensión de información compleja.

  • Eficiencia: Reduce significativamente el tiempo necesario para el análisis de datos.
  • Precisión: Ofrece un análisis exacto de las funciones genéticas con un margen de error mínimo.
  • Escalabilidad: Es capaz de manejar conjuntos de datos más grandes de manera más eficiente que los métodos tradicionales.
  • Innovación: Fomenta nuevas hipótesis que antes no se habían explorado.

Estas capacidades representan un cambio significativo en la forma en que los investigadores realizan estudios genómicos. Al automatizar el análisis de conjuntos de genes, los científicos pueden dedicar más tiempo a diseñar experimentos y aplicar sus descubrimientos. A medida que la tecnología avanza, los modelos de lenguaje a gran escala podrían ofrecer perspectivas personalizadas, propiciando nuevos avances en la medicina de precisión.

UC San Diego ha desarrollado un sitio web para facilitar a los investigadores el uso de modelos de lenguaje avanzado en sus proyectos. Esta iniciativa forma parte de un objetivo mayor que busca fomentar la colaboración en la ciencia. Al hacerlo, los investigadores pueden conectarse más fácilmente, acelerar sus descubrimientos y compartir sus métodos entre ellos.

La inteligencia artificial en la genómica no solo se limita al manejo de datos; también tiene la capacidad de generar rápidamente nuevas ideas de investigación, lo que acelera los descubrimientos. A medida que la IA avanza, puede transformar significativamente la investigación genómica, facilitando la colaboración entre la tecnología y la biología para comprender mejor la vida.

El estudio se publica aquí:

http://dx.doi.org/10.1038/s41592-024-02525-x

y su cita oficial - incluidos autores y revista - es

Mengzhou Hu, Sahar Alkhairy, Ingoo Lee, Rudolf T. Pillich, Dylan Fong, Kevin Smith, Robin Bachelder, Trey Ideker, Dexter Pratt. Evaluation of large language models for discovery of gene set function. Nature Methods, 2024; DOI: 10.1038/s41592-024-02525-x
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