AIで新時代のゲノム研究を開拓する──迅速かつ正確な遺伝子解析へ

読了時間: 2 分
によって Juanita Lopez
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DNA鎖を分析するAIアルゴリズムと発光回路

Tokyoゲノム研究において人工知能が急速に進化しています。カリフォルニア大学サンディエゴ校医学部の研究者たちは、GPT-4のような大規模言語モデルが機能ゲノミクスの作業を自動化するのに役立つことを示しました。この研究分野は、遺伝子の機能と相互作用を理解することに重点を置いており、従来は難解で時間を要していました。大規模言語モデルは、遺伝子セットを分析する新たな方法を提供し、この分野での科学者の働き方を大きく変える可能性を秘めています。

遺伝子セットのエンリッチメントは、機能ゲノミクスでよく使われる手法で、研究者が遺伝子グループをデータベースと比較し、それらの役割を理解しようとするものです。しかし、既存のデータベースはすべての生物学的側面を網羅しているわけではありません。この知識の隙間をAIが埋めることが期待されています。5つの大規模言語モデルを比較した研究で、GPT-4は最も優れた性能を示し、遺伝子の機能を特定する場合に73%の精度を達成しました。また、ランダムな遺伝子セットの87%で推測を控え、誤情報のリスクを軽減しました。

AIは、遺伝子やDNAの研究において多くの興味深い利点をもたらし、複雑な情報を理解する過程をより効率的かつ迅速にします。

  • 効率性: データ分析の時間を大幅に短縮します。
  • 正確性: 遺伝子機能を高精度で分析し、誤差を最小限に抑えます。
  • 拡張性: 従来の方法に比べて大規模なデータセットを効率的に処理できます。
  • 革新性: これまで探求されていなかった新たな仮説を促進します。

ゲノム研究におけるこのような能力の進化は、研究者の作業法を大きく変えています。遺伝子セット分析の自動化により、科学者たちは実験の設計や発見の応用により多くの時間を割くことができるようになりました。技術の進歩に伴い、大規模な言語モデルが個別の洞察を提供し、新たな精密医療の開発を促進する可能性があります。

UCサンディエゴは、研究者がプロジェクトで大規模言語モデルを活用できるよう支援するためのウェブサイトを立ち上げました。この取り組みは、科学の協力を促進するという大きな目標の一環です。それにより、研究者同士がより簡単に繋がり、新しい発見を迅速にし、方法を共有することが可能になります。

ゲノム学におけるAIは、単にデータを扱うだけでなく、新しい研究のアイデアを迅速に生み出し、成果の加速を可能にします。AIが進化するにつれて、ゲノム研究に大きな変革をもたらし、技術と生物学が協力して生命をより深く理解する手助けとなるでしょう。

この研究はこちらに掲載されています:

http://dx.doi.org/10.1038/s41592-024-02525-x

およびその公式引用 - 著者およびジャーナルを含む - は

Mengzhou Hu, Sahar Alkhairy, Ingoo Lee, Rudolf T. Pillich, Dylan Fong, Kevin Smith, Robin Bachelder, Trey Ideker, Dexter Pratt. Evaluation of large language models for discovery of gene set function. Nature Methods, 2024; DOI: 10.1038/s41592-024-02525-x
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