Utnyttja AI för att transformera genomikforskning och främja genanalys effektivt och precist
StockholmArtificiell intelligens gör snabba framsteg inom genomforskning. Vid University of California San Diego School of Medicine har forskare visat att stora språkmodeller, som GPT-4, kan bidra till att automatisera uppgifter inom funktionell genomik. Detta forskningsområde fokuserar på att förstå vad gener gör och hur de samverkar, vilket traditionellt har varit svårt och tidskrävande. Stora språkmodeller erbjuder ett nytt sätt att analysera gensatser och kan potentiellt förändra hur forskare arbetar inom detta område.
Gensetberikning är en välkänd metod inom funktionell genomik där forskare jämför grupper av gener med databaser för att bättre förstå deras funktioner. Trots detta täcker existerande databaser inte alltid alla delar av biologin, vilket leder till kunskapsluckor. AI kan bidra till att fylla dessa luckor. I en studie med fem stora språkmodeller presterade GPT-4 bäst, med en träffsäkerhet på 73% i att identifiera geners funktioner och valde att avstå från gissningar i 87% av fallen med slumpmässiga genset, vilket minskar risken för felaktig information.
AI erbjuder många spännande fördelar för gen- och DNA-forskning, vilket gör det enklare och snabbare att förstå komplexa data.
Effektivitet: Minimerar tiden som krävs för att analysera data avsevärt. Precision: Utför noggrann analys av genfunktioner med mycket små felmarginaler. Skalbarhet: Kan hantera större datamängder effektivare än traditionella metoder. Innovation: Främjar nya och tidigare outforskade hypoteser.
Dessa förmågor innebär en betydande förändring i hur forskare bedriver genomikstudier. Genom att automatisera analysen av genset kan forskarna ägna mer tid åt att designa experiment och tillämpa sina upptäckter. När teknologin utvecklas kan stora språkmodeller ge anpassade insikter, vilket leder till nya framsteg inom precisionsmedicin.
UC San Diego har lanserat en webbplats för att underlätta för forskare att använda stora språkmodeller i sina projekt. Initiativet är en del av ett större mål att främja samarbete inom vetenskapen. Genom detta kan forskare lättare knyta kontakter, snabbare göra upptäckter och dela sina metoder med varandra.
AI inom genomik handlar inte bara om att hantera data; det kan också snabbt generera nya forskningsidéer, vilket leder till snabbare genombrott. När AI utvecklas kan det förändra genomforskningen avsevärt genom att hjälpa teknik och biologi att samverka för att få en djupare förståelse av livet.
Studien publiceras här:
http://dx.doi.org/10.1038/s41592-024-02525-xoch dess officiella citering - inklusive författare och tidskrift - är
Mengzhou Hu, Sahar Alkhairy, Ingoo Lee, Rudolf T. Pillich, Dylan Fong, Kevin Smith, Robin Bachelder, Trey Ideker, Dexter Pratt. Evaluation of large language models for discovery of gene set function. Nature Methods, 2024; DOI: 10.1038/s41592-024-02525-x6 december 2024 · 10:53
Ny metod: förbättring av realistiskt 3D-formskapande med AI på MIT
6 december 2024 · 00:20
AI-boomen rosar Wall Street men ignorerar historiska varningar.
Dela den här artikeln