AI transformeert genoomonderzoek: snel een nieuwe stap richting precisiegeneeskunde en de volgende innovatietijdperken
AmsterdamKunstmatige intelligentie maakt snelle vooruitgang in genomica-onderzoek. Aan de Universiteit van Californië, San Diego School of Medicine, hebben onderzoekers aangetoond dat grote taalmodellen, zoals GPT-4, kunnen helpen taken in functionele genomica te automatiseren. Dit vakgebied richt zich op het begrijpen van de functie en interactie van genen, wat van oudsher ingewikkeld en tijdrovend is geweest. Grote taalmodellen bieden een nieuwe benadering voor het analyseren van genensets en kunnen de manier waarop wetenschappers in dit veld werken mogelijk veranderen.
AI kan kennislacunes overbruggen in functionele genomica
Genenverrijking is een veelgebruikte methode in functionele genomics, waarbij wetenschappers groepen genen vergelijken met databases om hun functies beter te begrijpen. Echter, bestaande databases dekken niet altijd elk aspect van de biologie, wat leidt tot kennishiaten. In een onderzoek naar vijf grote taalmodellen presteerde GPT-4 het beste met een nauwkeurigheid van 73% in het identificeren van genfuncties. Bovendien koos het model ervoor om bij 87% van de tests met willekeurige genensets geen gok te wagen, waardoor de kans op verkeerde informatie afnam.
AI biedt spannende voordelen voor het bestuderen van genen en DNA, waardoor complexe informatie eenvoudiger en sneller begrepen kan worden.
Efficiëntie: Vermindert aanzienlijk de tijd die nodig is voor data-analyse. Nauwkeurigheid: Biedt een precieze analyse van genfuncties met minimale foutmarge. Schaalbaarheid: Kan grotere datasets aan dan traditionele methoden. Innovatie: Stimuleert het formuleren van nieuwe, eerder onontgonnen hypotheses.
Deze vaardigheden markeren een grote verandering in de manier waarop onderzoekers genomische studies uitvoeren. Door de automatisering van genensetanalyses kunnen wetenschappers meer tijd besteden aan het ontwerpen van experimenten en het toepassen van hun bevindingen. Naarmate technologie verbetert, kunnen grote taalmodellen op maat gemaakte inzichten bieden die leiden tot nieuwe ontwikkelingen in de precisiegeneeskunde.
UC San Diego heeft een website ontwikkeld om onderzoekers te ondersteunen bij het gebruik van grote taalmodellen in hun projecten. Deze stap maakt deel uit van een bredere ambitie om samenwerking binnen de wetenschap te bevorderen. Hierdoor kunnen onderzoekers gemakkelijker verbinding maken, sneller ontdekkingen doen en hun methodes met elkaar delen.
AI in de genomica gaat verder dan alleen data-analyse; het kan snel nieuwe onderzoeksideeën genereren, wat leidt tot snellere doorbraken. Naarmate AI zich verder ontwikkelt, kan het genomica-onderzoek grondig veranderen door technologie en biologie samen te laten werken om het leven beter te begrijpen.
De studie is hier gepubliceerd:
http://dx.doi.org/10.1038/s41592-024-02525-xen de officiële citatie - inclusief auteurs en tijdschrift - is
Mengzhou Hu, Sahar Alkhairy, Ingoo Lee, Rudolf T. Pillich, Dylan Fong, Kevin Smith, Robin Bachelder, Trey Ideker, Dexter Pratt. Evaluation of large language models for discovery of gene set function. Nature Methods, 2024; DOI: 10.1038/s41592-024-02525-x10 december 2024 · 08:39
Onverwachte ontdekkingen: hoe AI in beeldvorming verborgen ziekten onthult en diagnose verbetert
Deel dit artikel