Ny studie: ovanliga T-celler och gener kopplade till immunologiska sjukdomar upptäckta
StockholmForskare från RIKEN IMS och Kyoto Universitet i Japan, tillsammans med IFOM ETS i Italien, har upptäckt ovanliga hjälpar T-celler som är kopplade till immunstörningar som multipel skleros, reumatoid artrit och astma. Deras forskning publicerades den 4 juli i tidskriften Science.
En ny teknologi vid namn ReapTEC bidrog till upptäckten. ReapTEC identifierar genetiska förstärkare i sällsynta T-celltyper som är kopplade till specifika immunsjukdomar. Forskargruppen undersökte cirka en miljon mänskliga T-celler för att hitta ovanliga T-celltyper som utgör mindre än 5 % av det totala antalet i provet.
Viktiga resultat inkluderar följande: Identifiering av cirka 63 000 aktiva bidirektionella förstärkare i dessa sällsynta T-celler. Genetiska varianter för immunsystemrelaterade sjukdomar finns inom dessa förstärkare. Specifika förstärkare kopplas samman med 18 olika immunsystemrelaterade sjukdomar.
Hjälpar T-celler är vita blodkroppar som är viktiga för immunförsvaret. De identifierar skadliga ämnen och styr kroppens försvarsreaktion. Problem med T-cellernas funktioner kan leda till sjukdomar. Till exempel, vid multipel skleros angriper T-celler kroppen felaktigt. Vid allergier överreagerar T-celler på saker som pollen.
Forskare använde genome-wide association studies (GWAS) för att jämföra genetiska skillnader med sina ReapTEC-data. De upptäckte att genetiska skillnader kopplade till immunsjukdomar ofta var belägna inom förstärkar-DNA:t hos de sällsynta T-celler de identifierade. I motsats till detta visade neurologiska sjukdomar inte detta mönster, vilket tyder på att dessa förstärkare är specifikt förknippade med immunsjukdomar.
Av de 63 000 bidirektionella förstärkare identifierade de 606 som hade enkel-nukleotidpolymorfismer kopplade till olika immunstörningar. Till exempel, när de aktiverade en förstärkare associerad med inflammatorisk tarmsjukdom, orsakade förstärkar-RNA en ökning i IL7R-gens aktivitet.
Dr. Yasuhiro Murakawa, som leder forskningen, påpekade att deras nya genomikmetod kan användas av forskare överallt. Han anser att förståelsen av dessa genetiska processer kommer att bidra till utvecklingen av nya behandlingar för immunrelaterade sjukdomar.
Denna upptäckt är betydelsefull eftersom forskare nu kan koncentrera sig på dessa ovanliga T-celler för att utveckla nya läkemedel. Den belyser också hur komplicerat immunsystemet är och fördelarna med detaljerad genomisk analys. Denna metod kan avsevärt förbättra vår förståelse och behandling av immunstörningar.
Att ha en offentligt tillgänglig T-cellatlas kommer vara ett värdefullt verktyg. Forskare globalt kan använda denna data för att utveckla nya behandlingar. Ytterligare experiment kommer antagligen upptäcka nya molekyler som riktar in sig på dessa förstärkare, vilket kan leda till nya terapier.
Denna forskning har stor inverkan på hur vi förstår och behandlar sjukdomar som drabbar många människor. Framtida studier som använder dessa data kan leda till betydande framsteg i hanteringen av immunrelaterade tillstånd.
Studien publiceras här:
http://dx.doi.org/10.1126/science.add8394och dess officiella citering - inklusive författare och tidskrift - är
Akiko Oguchi, Akari Suzuki, Shuichiro Komatsu, Hiroyuki Yoshitomi, Shruti Bhagat, Raku Son, Raoul Jean Pierre Bonnal, Shohei Kojima, Masaru Koido, Kazuhiro Takeuchi, Keiko Myouzen, Gyo Inoue, Tomoya Hirai, Hiromi Sano, Yujiro Takegami, Ai Kanemaru, Itaru Yamaguchi, Yuki Ishikawa, Nao Tanaka, Shigeki Hirabayashi, Riyo Konishi, Sho Sekito, Takahiro Inoue, Juha Kere, Shunichi Takeda, Akifumi Takaori-Kondo, Itaru Endo, Shinpei Kawaoka, Hideya Kawaji, Kazuyoshi Ishigaki, Hideki Ueno, Yoshihide Hayashizaki, Massimiliano Pagani, Piero Carninci, Motoko Yanagita, Nicholas Parrish, Chikashi Terao, Kazuhiko Yamamoto, Yasuhiro Murakawa, Matteo Guerrini, Hiroaki Hatano, Kazuyoshi Ishigaki, Yuki Ishikawa, Shuichiro Komatsu, Michihiro Kono, Yasuhiro Murakawa, Masahiro Nakano, Akiko Oguchi, Raku Son, Akari Suzuki, Kazuhiro Takeuchi, Nao Tanaka, Chikashi Terao, Kohei Tomizuka, Kazuhiko Yamamoto, Soichiro Yoshino. An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases. Science, 2024; 385 (6704) DOI: 10.1126/science.add8394Idag · 09:53
Avkoda pronomen: hjärnans roll i minne avslöjad
Idag · 04:08
Rödljus stoppar skadedjur: insektslivet upphör
Dela den här artikeln