Nieuwe doorbraak: zeldzame T-cellen en genen gelinkt aan immuunziekten ontdekt
AmsterdamWetenschappers van RIKEN IMS en Kyoto University in Japan, samen met IFOM ETS in Italië, hebben zeldzame helper-T-cellen ontdekt die verband houden met immuunstoornissen zoals multiple sclerose, reumatoïde artritis en astma. Hun onderzoek werd op 4 juli gepubliceerd in het tijdschrift Science.
Een baanbrekende technologie genaamd ReapTEC heeft bijgedragen aan deze ontdekking. ReapTEC identificeert genetische versterkers in zeldzame T-celtypen die gelinkt zijn aan specifieke immuunziekten. Het team analyseerde ongeveer een miljoen menselijke T-cellen om de zeldzame T-celtypen te vinden die minder dan 5% van de totale populatie in het monster uitmaken.
Belangrijke resultaten:
- Ongeveer 63.000 actieve bidirectionele versterkers geïdentificeerd in deze zeldzame T-cellen.
- Genetische varianten voor immuun-gemedieerde ziektes gevonden binnen deze versterkers.
- Specifieke versterkers gekoppeld aan 18 verschillende immuun-gemedieerde ziektes.
Helper T-cellen zijn cruciale witte bloedcellen voor het immuunsysteem. Ze herkennen schadelijke stoffen en regelen de afweerreactie van het lichaam. Problemen met de functies van T-cellen kunnen tot ziektes leiden. Bijvoorbeeld, bij multiple sclerose vallen T-cellen het eigen lichaam aan. Bij allergieën reageren T-cellen overdreven op zaken zoals pollen.
Onderzoekers gebruikten genome-wide associatiestudies (GWAS) om genetische verschillen te vergelijken met hun ReapTEC-data. Ze ontdekten dat genetische variaties die samenhangen met immuunziekten vaak binnen de enhancer-DNA's van de zeldzame T-cellen zitten die ze hadden geïdentificeerd. In tegenstelling daarmee toonden neurologische aandoeningen dit patroon niet, wat suggereert dat deze enhancers specifiek geassocieerd zijn met immuungerelateerde ziekten.
Uit de 63.000 bidirectionele enhancers, identificeerden ze 606 enhancers die enkel-nucleotide polymorfismen hadden die gelinkt zijn aan verschillende immuunstoornissen. Bijvoorbeeld, toen ze een enhancer activeerden die geassocieerd is met inflammatoire darmziekte, zorgde het enhancer-RNA voor een toename in de activiteit van het IL7R-gen.
Dr. Yasuhiro Murakawa, die het onderzoek leidt, verklaarde dat hun nieuwe genomische methode wereldwijd door onderzoekers kan worden gebruikt. Hij denkt dat inzicht in deze genetische processen zal helpen bij het ontwikkelen van nieuwe behandelingen voor auto-immuunziekten.
Deze ontdekking is cruciaal omdat onderzoekers zich nu kunnen richten op deze zeldzame T-cellen om nieuwe medicijnen te ontwikkelen. Daarnaast toont het aan hoe ingewikkeld het immuunsysteem is en de voordelen van gedetailleerde genetische analyse. Deze methode kan onze kennis en behandeling van immuunstoornissen aanzienlijk verbeteren.
Een publiek toegankelijke T-celatlas zal een waardevol hulpmiddel zijn. Onderzoekers wereldwijd kunnen deze informatie gebruiken om nieuwe behandelingsopties te vinden. Vervolgexperimenten zullen waarschijnlijk nieuwe moleculen ontdekken die deze enhancers richten, wat zal leiden tot nieuwe therapieën.
Dit onderzoek heeft verstrekkende gevolgen voor ons begrip en de behandeling van ziektes die veel mensen treffen. Toekomstige studies met deze gegevens kunnen mogelijk aanzienlijke verbeteringen opleveren in de aanpak van immuungerelateerde aandoeningen.
De studie is hier gepubliceerd:
http://dx.doi.org/10.1126/science.add8394en de officiële citatie - inclusief auteurs en tijdschrift - is
Akiko Oguchi, Akari Suzuki, Shuichiro Komatsu, Hiroyuki Yoshitomi, Shruti Bhagat, Raku Son, Raoul Jean Pierre Bonnal, Shohei Kojima, Masaru Koido, Kazuhiro Takeuchi, Keiko Myouzen, Gyo Inoue, Tomoya Hirai, Hiromi Sano, Yujiro Takegami, Ai Kanemaru, Itaru Yamaguchi, Yuki Ishikawa, Nao Tanaka, Shigeki Hirabayashi, Riyo Konishi, Sho Sekito, Takahiro Inoue, Juha Kere, Shunichi Takeda, Akifumi Takaori-Kondo, Itaru Endo, Shinpei Kawaoka, Hideya Kawaji, Kazuyoshi Ishigaki, Hideki Ueno, Yoshihide Hayashizaki, Massimiliano Pagani, Piero Carninci, Motoko Yanagita, Nicholas Parrish, Chikashi Terao, Kazuhiko Yamamoto, Yasuhiro Murakawa, Matteo Guerrini, Hiroaki Hatano, Kazuyoshi Ishigaki, Yuki Ishikawa, Shuichiro Komatsu, Michihiro Kono, Yasuhiro Murakawa, Masahiro Nakano, Akiko Oguchi, Raku Son, Akari Suzuki, Kazuhiro Takeuchi, Nao Tanaka, Chikashi Terao, Kohei Tomizuka, Kazuhiko Yamamoto, Soichiro Yoshino. An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases. Science, 2024; 385 (6704) DOI: 10.1126/science.add8394Vandaag · 04:08
Fruitvliegjes stilgezet: rood licht stopt navigatie
Deel dit artikel