Neue Forschung: Tageszeit könnte die Reproduzierbarkeit in der Mikrobiom-Forschung verbessern
BerlinWissenschaftler der Universität von Kalifornien in San Diego haben entdeckt, dass die Tageszeit das Darmmikrobiom beeinflusst. Diese Erkenntnis könnte dazu beitragen, Probleme mit der Wiederholbarkeit in Mikrobiomstudien zu lösen. Forscher wussten bereits, dass Faktoren wie Ernährung, Lebensbedingungen, Bewegung und mütterliche Linie den Darm beeinflussen. Jetzt erkennen sie, dass auch die Tageszeit eine Rolle spielt.
- Ernährung
- Lebensbedingungen
- Körperliche Aktivität
- Mütterliche Linie
- Tageszeit
Die Forscher veröffentlichten ihre Ergebnisse in Nature Metabolism. Sie fanden heraus, dass sich das Darmmikrobiom im Laufe des Tages stark verändert. Morgens sind andere Mikrobenarten vorhanden als abends. Beispielsweise zeigt eine Stuhlprobe beim Frühstück andere Resultate als eine Probe vor dem Abendessen.
Amir Zarrinpar, M.D., Ph.D., betonte, dass der Zeitpunkt der Probenentnahme einen großen Einfluss auf die Arten von Mikroben hat, die gefunden werden, und auf die Schlussfolgerungen, die Wissenschaftler über die erforschte Krankheit ziehen.
Forschungsabweichungen könnten darauf zurückzuführen sein, wann Proben entnommen wurden. Zarrinpar kam beim Gespräch mit einem Kollegen auf eine Idee. Der Kollege erzählte, dass ein Postdoc die Ergebnisse eines früheren Trainees nicht reproduzieren konnte, weil der Postdoc die Proben zu einer anderen Tageszeit sammelte und dabei auf andere Bakterien stieß.
Die Forschung zum Mikrobiom hat Schwierigkeiten mit der Reproduzierbarkeit von Ergebnissen. Diese Problematik ergibt sich aus der notwendigen interdisziplinären Herangehensweise, den komplexen Wechselwirkungen zwischen Mikroben und Wirten sowie der Herausforderung, viele Einflussfaktoren zu kontrollieren. Auch die Zeitspanne spielt eine bedeutende Rolle.
Zarrinpar ist der Auffassung, dass das richtige Timing das Problem lösen könnte. Er erläuterte, dass unterschiedliche Ergebnisse darauf zurückzuführen sein könnten, zu welchen Zeiten die Proben entnommen werden. Er fordert das NIH auf, die Forscher zu bitten, die Probenentnahmezeit zu notieren.
Wissenschaftler in Bereichen wie der Chronobiologie betonen, dass das Timing in Experimenten eine entscheidende Rolle spielt. Diese Studie soll anderen Forschern und Geldgebern die Bedeutung des Timings verdeutlichen. Darüber hinaus könnte sie auch das Verständnis in Bereichen wie der Stoffwechselforschung ändern.
Die nächsten Schritte umfassen die Festlegung einheitlicher Richtlinien für das Sammeln von Proben. Dafür ist die Zusammenarbeit mit anderen Forschern, Förderinstitutionen und Zeitschriftenherausgebern notwendig. Zarrinpars kommende Untersuchung wird sich damit befassen, wie der Zeitpunkt die Menschen beeinflusst. Studien an Menschen sind komplexer, da es schwieriger ist, die Variablen zu kontrollieren.
Diese Studie wurde durch Mittel des Nationalen Instituts für Gesundheit, der Soros-Stiftung und der Amerikanischen Krankenhausvereinigung unterstützt. Die Mitautoren sind Wissenschaftler der Universität von Kalifornien in San Diego und der Universität von Wisconsin-Madison.
Die Studie wird hier veröffentlicht:
http://dx.doi.org/10.1038/s42255-024-01064-1und seine offizielle Zitation - einschließlich Autoren und Zeitschrift - lautet
Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, R. Alexander Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Vanessa A. Leone, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight, Amir Zarrinpar. Time of sample collection is critical for the replicability of microbiome analyses. Nature Metabolism, 2024; DOI: 10.1038/s42255-024-01064-1Heute · 03:33
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