微生物研究の再現性問題、時間の観点で解決の可能性がある新研究

Tokyoカリフォルニア大学サンディエゴ校の科学者たちは、腸内細菌叢が日中の時間に影響を受けることを発見しました。この発見は、腸内細菌叢の研究における再現性の問題解決に役立つ可能性があります。研究者たちは以前から、食事、生活環境、運動、母系の影響が腸内に及ぼすことは知っていましたが、さらに一日の時間も影響することが分かりました。

• 食事
• 生活環境
• 運動
• 母系
• 時間帯

チームは彼らの研究結果を「ネイチャーメタボリズム」に発表しました。彼らは腸内細菌叢が1日の中で大きく変化することを発見しました。朝と夜とでは異なる種類の微生物が存在しています。例えば、朝食時に採取した便のサンプルは、夕食前に採取したものとは異なる結果を示します。

アミール・ザリンパール医学博士は、サンプルの収集時期が微生物の種類に大きく影響を与え、研究中の疾患に関する科学者の結論にも重大な影響を及ぼす可能性があると説明しました。

研究者たちは、過去の研究データを含むコンピューターデータを調査しました。彼らは、食生活の変化に似て、腸内細菌叢は日々大きく変動することを発見しました。ザリンパー氏は、「マウスが朝食を食べたわずか4時間後には、腸内細菌叢の約80％が異なっている」と述べています。

研究の不一致は、サンプルを収集した時期による可能性があります。ザリンパーは、同僚と話していたときにアイデアを得ました。その同僚によれば、あるポスドクが以前の研修生の結果を再現できなかったのは、ポスドクが異なる時間帯にサンプルを収集し、それによって異なる細菌が見つかったからだということです。

研究者たちは、実験結果の違いにより、お互いの実験を再現するのに苦労しています。ザリンパール氏は、「これらの違いや同じ結果が得られない原因として、腸内細菌叢が一日の中で変化することが考えられます」と述べています。

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微生物群研究では、結果の再現性に問題があります。この問題は、分野が多様な知識を必要とし、微生物と宿主の相互作用が複雑であり、多くの要因を管理することが困難なことに起因しています。また、タイミングも重要な要素です。

ザリンパー氏は、時間の重要性を認識することが問題解決の鍵になると考えている。彼は、異なる結果が出る原因は、サンプルが採取される時間帯にあるかもしれないと説明した。彼は、NIHに対して研究者にサンプル採取時間を記録するよう依頼することを望んでいる。

サーカディアン生物学の専門家たちは、実験においてタイミングが非常に重要であると述べています。この研究は、他の科学者や資金提供者に対してタイミングの重要性を示すことを目的としています。また、代謝研究などの分野にも影響を与える可能性があります。

次のステップは、サンプル収集のタイミングと方法に関する合意されたガイドラインを策定することです。このためには、他の研究者や資金提供機関、学術誌の編集者との協力が必要です。ザリンパーの次の研究では、タイミングが人々に与える影響を探求します。人間に関する研究は、変数を制御するのが難しいため、より複雑です。

この研究は、アメリカ国立衛生研究所、ソロス財団、アメリカ病院協会から資金提供を受けました。共同著者は、カリフォルニア大学サンディエゴ校とウィスコンシン大学マディソン校の科学者たちです。