Nowe badanie: czas doby może poprawić powtarzalność wyników badań nad mikrobiomem jelitowym

Czas czytania: 2 minut
Przez Maria Lopez
- w
Zegar z ikonami przedstawiającymi żołądek i bakterie wokół niego.

WarsawNaukowcy z Uniwersytetu Kalifornijskiego w San Diego odkryli, że pora dnia ma wpływ na mikrobiom jelitowy. To odkrycie może pomóc rozwiązać problemy z powtarzalnością w badaniach dotyczących mikrobiomu. Badacze wiedzieli już, że na mikrobiom wpływają czynniki takie jak dieta, warunki życia, ćwiczenia fizyczne oraz linia matki. Teraz zdają sobie sprawę, że pora dnia również odgrywa istotną rolę.

  • Dieta
  • Warunki życia
  • Aktywność fizyczna
  • Linia matczyna
  • Pora dnia

Zespół opublikował swoje odkrycia w czasopiśmie Nature Metabolism. Odkryli, że mikrobiom jelitowy ulega znacznym zmianom w ciągu dnia. Różne typy drobnoustrojów występują rano i wieczorem. Na przykład próbka kału pobrana podczas śniadania daje inne wyniki niż ta pobrana przed kolacją.

Amir Zarrinpar, M.D., Ph.D., wyjaśnił, że moment pobrania próbek może mieć znaczący wpływ na rodzaje mikroorganizmów odkrywanych oraz na wnioski, jakie naukowcy wyciągają dotyczące badanej choroby.

Nieścisłości w badaniach mogą wynikać z momentu, w którym pobierano próbki. Zarrinpar wpadł na pomysł po rozmowie z kolegą, który wspomniał, że doktorant nie mógł odtworzyć wyników poprzedniego badacza, ponieważ próbki pobierał o innej porze dnia, co skutkowało znalezieniem innych bakterii.

Badacze mają trudności z powtórzeniem nawzajem swoich eksperymentów z powodu różnic w wynikach. „Te różnice i brak możliwości uzyskania takich samych rezultatów mogą wynikać z tego, że mikrobiom zmienia się w ciągu dnia,” powiedział Zarrinpar.

Badania nad mikrobiomem napotykają trudności z powtarzalnością wyników. Ten problem wynika z konieczności integracji wiedzy z różnych dziedzin, skomplikowanej interakcji między drobnoustrojami a gospodarzami oraz trudności w kontrolowaniu wielu czynników. Ważnym elementem w tych badaniach jest także czas.

Zarrinpar uważa, że zrozumienie znaczenia odpowiedniego momentu może rozwiązać problem. Wyjaśnił, że różne wyniki mogą wynikać z czasu, w którym są pobierane próbki. Chce, aby NIH poprosił badaczy o zanotowanie czasu pobrania próbek.

Naukowcy w dziedzinach takich jak biologia okołodobowa twierdzą, że czas odgrywa kluczową rolę w eksperymentach. Niniejsze badanie ma na celu udowodnienie innym naukowcom oraz fundatorom, jak istotne może być odpowiednie wyczucie czasu. Może to również wpłynąć na takie obszary jak badania nad metabolizmem.

Kolejnym krokiem jest dążenie do uzgodnienia wytycznych dotyczących momentów i sposobów zbierania próbek. To będzie wymagało współpracy z innymi naukowcami, agencjami finansującymi oraz redaktorami czasopism. Kolejne badanie Zarrinpara skoncentruje się na wpływie czasu na ludzi. Badania na ludziach są trudniejsze, ponieważ trudniej jest kontrolować zmienne.

Badanie to uzyskało finansowanie z National Institutes of Health, Fundacji Sorosa oraz Amerykańskiego Stowarzyszenia Szpitali. Współautorzy to naukowcy z UC San Diego oraz Uniwersytetu Wisconsin-Madison.

Badanie jest publikowane tutaj:

http://dx.doi.org/10.1038/s42255-024-01064-1

i jego oficjalne cytowanie - w tym autorzy i czasopismo - to

Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, R. Alexander Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Vanessa A. Leone, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight, Amir Zarrinpar. Time of sample collection is critical for the replicability of microbiome analyses. Nature Metabolism, 2024; DOI: 10.1038/s42255-024-01064-1
Nauka: Najnowsze wiadomości
Czytaj dalej:

Udostępnij ten artykuł

Komentarze (0)

Opublikuj komentarz