Une nouvelle étude révèle que l'heure de collecte des échantillons influence les recherches sur le microbiome

ParisDes scientifiques de l'Université de Californie à San Diego ont découvert que l'heure de la journée influence le microbiome intestinal. Cette découverte pourrait aider à résoudre les problèmes de reproductibilité dans les études sur le microbiome. Les chercheurs savaient déjà que des facteurs tels que l'alimentation, les conditions de vie, l'exercice et la lignée maternelle influencent le microbiome intestinal. Désormais, ils réalisent que l'heure de la journée joue également un rôle clé.

• Régime alimentaire
• Conditions de vie
• Activité physique
• Lignée maternelle
• Moment de la journée

L'équipe a publié ses découvertes dans Nature Metabolism. Ils ont observé que le microbiome intestinal varie considérablement au cours de la journée. Le matin, les types de microbes présents diffèrent de ceux du soir. Par exemple, un échantillon de selles prélevé au petit-déjeuner révèle des résultats distincts de ceux d'un prélèvement effectué avant le dîner.

Amir Zarrinpar, M.D., Ph.D., a expliqué que le moment de la collecte des échantillons peut fortement influencer les types de microbes découverts et les conclusions que les scientifiques tirent sur la maladie qu'ils étudient.

Les inconsistances de recherche pourraient être liées au moment de la collecte des échantillons. Zarrinpar a eu une idée après avoir discuté avec un collègue : un postdoctorant n'arrivait pas à reproduire les résultats d'un ancien stagiaire parce qu'il avait prélevé les échantillons à une autre heure de la journée et avait trouvé des bactéries différentes.

La recherche sur le microbiome rencontre des difficultés à reproduire les résultats. Ce problème provient de la nécessité de combiner des connaissances de divers domaines, de la complexité des interactions entre les microbes et leurs hôtes, et de la gestion difficile de nombreux facteurs. Le paramètre de temps joue également un rôle crucial.

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Zarrinpar pense que comprendre l'importance du timing peut résoudre le problème. Il a expliqué que les résultats peuvent varier selon le moment où les échantillons sont prélevés. Il souhaite que le NIH demande aux chercheurs de noter l'heure de collecte des échantillons.

Les chercheurs en chronobiologie affirment que le moment est crucial dans les expériences. Cette étude cherche à démontrer aux scientifiques et financeurs l'importance du facteur temps. Elle pourrait également transformer des domaines comme la recherche en métabolisme.

Les prochaines étapes consistent à établir des directives consensuelles pour préciser quand et comment recueillir les échantillons. Cela nécessitera une collaboration avec d'autres chercheurs, des agences de financement et des éditeurs de revues scientifiques. La prochaine étude de Zarrinpar portera sur l'impact du moment de la journée sur les individus. Les études humaines sont plus complexes en raison de la difficulté à contrôler les variables.

Cette étude a été financée par les National Institutes of Health, la Fondation Soros et l'American Hospital Association. Les co-auteurs de cette recherche sont des scientifiques de l'Université de Californie à San Diego et de l'Université du Wisconsin à Madison.