Nuevo estudio: el horario puede solucionar la crisis de replicabilidad en la investigación del microbioma

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Por Maria Lopez
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Reloj con iconos de estómago y bacterias a su alrededor

MadridCientíficos de la Universidad de California en San Diego han descubierto que la hora del día influye en el microbioma intestinal. Este hallazgo podría ayudar a resolver problemas de repetibilidad en estudios sobre el microbioma. Los investigadores ya sabían que factores como la dieta, las condiciones de vida, el ejercicio y la línea materna afectan al intestino. Ahora se han dado cuenta de que la hora del día también juega un papel importante.

  • Alimentación
  • Condiciones de vida
  • Ejercicio físico
  • Línea materna
  • Hora del día

El equipo publicó sus hallazgos en Nature Metabolism. Descubrieron que el microbioma intestinal varía significativamente a lo largo del día. Hay diferentes tipos de microbios en la mañana en comparación con la tarde. Por ejemplo, una muestra de heces tomada en el desayuno presenta resultados diferentes a una recogida antes de la cena.

Amir Zarrinpar, M.D., Ph.D., explicó que el momento de la recolección de muestras puede influir enormemente en los tipos de microbios encontrados y en las conclusiones que los científicos hacen sobre la enfermedad que investigan.

Las inconsistencias en la investigación podrían deberse al momento en que se recolectaron las muestras. Zarrinpar tuvo una idea tras hablar con un colega, quien le mencionó que un postdoctorado no pudo reproducir los resultados de un investigador anterior porque el postdoctorado recolectó las muestras a una hora del día diferente y encontró bacterias distintas.

La investigación del microbioma enfrenta dificultades para reproducir los resultados. Este problema surge porque el campo requiere conocimientos de diversas áreas, la interacción entre microbios y hospedadores es compleja, y es complicado manejar múltiples factores. Además, el momento es un factor crucial.

Zarrinpar cree que entender la importancia del tiempo puede resolver el problema. Explicó que las diferencias en los resultados podrían deberse a la hora en que se toman las muestras. Quiere que el NIH pida a los investigadores que anoten la hora de recolección de las muestras.

Los científicos en áreas como la biología circadiana afirman que la sincronización es crucial en los experimentos. Este estudio busca demostrar a otros científicos y financiadores la importancia de la sincronización. Además, podría influir en campos como la investigación del metabolismo.

Los próximos pasos incluyen establecer directrices consensuadas sobre cuándo y cómo tomar muestras. Esto implicará colaborar con otros investigadores, agencias financiadoras y editores de revistas científicas. El siguiente estudio de Zarrinpar analizará cómo el momento influye en las personas. Los estudios en humanos son más complicados porque es más difícil controlar las variables.

Este estudio contó con el apoyo financiero de los Institutos Nacionales de Salud, la Fundación Soros y la Asociación Americana de Hospitales. Los coautores son científicos de UC San Diego y la Universidad de Wisconsin-Madison.

El estudio se publica aquí:

http://dx.doi.org/10.1038/s42255-024-01064-1

y su cita oficial - incluidos autores y revista - es

Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, R. Alexander Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Vanessa A. Leone, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight, Amir Zarrinpar. Time of sample collection is critical for the replicability of microbiome analyses. Nature Metabolism, 2024; DOI: 10.1038/s42255-024-01064-1
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