Nieuwe studie: tijdstip van monstername kan repliceerbaarheid in microbiomeonderzoek verbeteren

AmsterdamWetenschappers van de Universiteit van Californië in San Diego hebben ontdekt dat het tijdstip van de dag invloed heeft op het darmmicrobioom. Deze ontdekking kan helpen bij het oplossen van problemen met de herhaalbaarheid van microbiomstudies. Onderzoekers wisten al dat factoren zoals voeding, leefomstandigheden, beweging en de maternale lijn van invloed zijn op de darmen. Nu begrijpen ze dat ook het tijdstip van de dag een rol speelt.

• Voeding
• Leefomstandigheden
• Lichaamsbeweging
• Moederlijke lijn
• Tijdstip van de dag

Het team heeft hun bevindingen gepubliceerd in Nature Metabolism. Ze ontdekten dat het darmmicrobioom gedurende de dag sterk verandert. Er zijn namelijk verschillende soorten microben in de ochtend vergeleken met de avond. Zo geeft een ontlastingsmonster genomen bij het ontbijt andere resultaten dan een monster dat vóór het avondeten wordt afgenomen.

Amir Zarrinpar, M.D., Ph.D., legde uit dat het moment van monsterafname een grote invloed kan hebben op de soorten microben die worden aangetroffen en de conclusies die wetenschappers trekken over de ziekte die ze onderzoeken.

Onderzoek naar inconsistenties kan te wijten zijn aan het moment waarop de monsters werden verzameld. Zarrinpar kreeg een ingeving na een gesprek met een collega, die vertelde dat een postdoc de resultaten van een eerdere trainee niet kon reproduceren omdat de postdoc de monsters op een ander tijdstip van de dag had genomen en daardoor andere bacteriën had gevonden.

Microbioomonderzoek kampt met uitdagingen in het herhalen van resultaten. Dit komt doordat het vakgebied kennis vereist uit verschillende disciplines, de interactie tussen microben en gastheren complex is en veel factoren moeilijk te beheersen zijn. Ook het juiste moment speelt een cruciale rol.

Lees ook:

Vandaag · 01:33

Betovering door geluid: magie voor blinden mogelijk?

Zarrinpar denkt dat het bewust worden van het belang van timing kan helpen het probleem op te lossen. Hij legde uit dat verschillende resultaten mogelijk te wijten zijn aan het tijdstip waarop monsters worden genomen. Hij wil dat de NIH onderzoekers vraagt om de tijd van monsterafname te noteren.

Wetenschappers in disciplines zoals circadiane biologie benadrukken dat tijdstip van wezenlijk belang is voor experimenten. Dit onderzoek wil aantonen hoe cruciaal timing is voor andere wetenschappers en subsidieverstrekkers. Het kan ook invloed hebben op gebieden zoals het metabolisme-onderzoek.

De volgende stappen zijn het opstellen van overeengekomen richtlijnen voor het verzamelen van monsters. Dit vereist samenwerking met andere onderzoekers, financieringsinstanties en redacteuren van wetenschappelijke tijdschriften. In Zarrinpars volgende onderzoek wordt gekeken naar hoe timing mensen beïnvloedt. Onderzoek bij mensen is uitdagender omdat het moeilijker is om de variabelen te beheersen.

Deze studie ontving financiering van de National Institutes of Health, de Soros Foundation en de American Hospital Association. De mede-auteurs zijn wetenschappers van de UC San Diego en de Universiteit van Wisconsin-Madison.