Ny studie: Tid på dagen kan lösa reproducerbarhetskrisen i mikrobiomforskning

Lästid: 2 minuter
Av Maria Lopez
- i
Klocka med ikoner av mage och bakterier runtomkring.

StockholmForskare vid University of California San Diego har upptäckt att tidpunkten på dagen påverkar tarmmikrobiomet. Denna upptäckt kan bidra till att lösa problem med reproducerbarhet i mikrobiomstudier. Tidigare visste forskare redan att faktorer som kost, levnadsförhållanden, motion och moderlinje påverkar tarmen. Nu inser de att även tidpunkten på dagen har en betydelse.

  • Kosthållning
  • Levnadsförhållanden
  • Fysisk aktivitet
  • Moderslinje
  • Tid på dygnet

Forskargruppen publicerade sina resultat i Nature Metabolism. De upptäckte att tarmmikrobiomet förändras mycket under dagen. Det finns olika typer av mikrober på morgonen jämfört med kvällen. Till exempel visar ett avföringsprov taget vid frukost andra resultat än ett som tas före middag.

Amir Zarrinpar, M.D., Ph.D., påpekade att tidpunkten för provtagning kan starkt påverka vilka typer av mikrober som upptäcks och vilka slutsatser forskare drar om den sjukdom de undersöker.

Forskningsavvikelser kan bero på tidpunkten för provtagningen. Zarrinpar fick en idé efter att ha pratat med en kollega, som berättade att en postdoktor inte kunde reproducera resultaten från en tidigare trainee eftersom postdoktorn samlade in prover vid en annan tidpunkt på dagen och därmed hittade olika bakterier.

Mikrobiomforskning har problem med att upprepa resultat. Detta problem uppstår eftersom fältet kräver kunskap från olika områden, interaktionen mellan mikrober och värdar är komplex och det är svårt att hantera många variabler. Tidpunkt är också en viktig faktor.

Zarrinpar anser att förståelsen för tidpunkternas betydelse kan lösa problemet. Han förklarade att olika resultat kan bero på vid vilken tidpunkt proverna tas. Han vill att NIH ska be forskare att notera tidpunkten för provtagning.

Forskare inom områden som cirkadiansk biologi menar att tidpunkten är mycket betydelsefull i experiment. Denna studie syftar till att visa andra forskare och finansiärer hur avgörande tidpunkten kan vara. Det kan även påverka områden som metabolismforskning.

Nästa steg är att driva på för överenskomna riktlinjer för när och hur prover ska samlas in. Detta kommer att kräva samarbeten med andra forskare, finansiärer och vetenskapliga tidskrifters redaktörer. Zarrinpars nästa studie kommer att undersöka hur tidpunkten påverkar människor. Studier på människor är svårare eftersom det är mer komplicerat att kontrollera variablerna.

Denna studie fick finansiering från National Institutes of Health, Soros Foundation och American Hospital Association. Medförfattarna är forskare från UC San Diego och University of Wisconsin-Madison.

Studien publiceras här:

http://dx.doi.org/10.1038/s42255-024-01064-1

och dess officiella citering - inklusive författare och tidskrift - är

Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, R. Alexander Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Vanessa A. Leone, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight, Amir Zarrinpar. Time of sample collection is critical for the replicability of microbiome analyses. Nature Metabolism, 2024; DOI: 10.1038/s42255-024-01064-1
Vetenskap: Senaste nytt
Läs nästa:

Dela den här artikeln

Kommentarer (0)

Posta en kommentar
NewsWorld

NewsWorld.app är en gratis premium nyhetssida. Vi tillhandahåller oberoende och högkvalitativa nyheter utan att ta betalt per artikel och utan en prenumerationsmodell. NewsWorld anser att allmänna, affärs-, ekonomiska, tekniska och underhållningsnyheter bör vara tillgängliga på en hög nivå gratis. Dessutom är NewsWorld otroligt snabb och använder avancerad teknik för att presentera nyhetsartiklar i ett mycket läsbart och attraktivt format för konsumenten.


© 2024 NewsWorld™. Alla rättigheter reserverade.