Nowa metoda odkrywania niebadanych genów może pomóc w badaniach nad chorobą Parkinsona.

WarsawZespół z Uniwersytetu Hiroszima osiągnął znaczący postęp w identyfikacji genów związanych z chorobami ludzkimi, które do tej pory były słabo zbadane. Opracowali nową metodę, która uzupełnia luki w danych występujących w istniejących bazach danych genów i chorób. Bazy te, takie jak Open Targets Platform i DisGeNET, często zawierają błędy, uprzedzenia oraz pomyłki wynikające z analizy tekstowej. Nowa metoda zespołu eliminuje te problemy i stanowi solidne narzędzie dla badań naukowych.

Rurociąg został przetestowany na przykładzie stresu oksydacyjnego i choroby Parkinsona. Oto przegląd ich działań:

• Zidentyfikuj geny reagujące zarówno na stres oksydacyjny, jak i na chorobę Parkinsona, analizując dane o ekspresji genów oraz badania asocjacyjne całego transkryptomu.
• Uzyskaj dostęp do wielu publicznych baz danych, aby zawęzić listę genów, które wcześniej nie były powiązane z chorobą Parkinsona.
• Wyszczególnij najważniejsze geny poprzez dalszą analizę danych.

Naukowcy postanowili zidentyfikować istotne, ale mało zbadane geny, aby lepiej zrozumieć i leczyć choroby. Rozpoczęli badania od 62 226 genów i zawęzili listę do 168, które wykazywały nietypową aktywność w chorobie Parkinsona oraz w stresie oksydacyjnym. Po dalszych analizach wyłonili 12 kluczowych genów, z których nuclear protein 1 (NUPR1) i ubiquitin-like with PHD and ring finger domains 2 (UHRF2) były najbardziej znaczące.

Ta metoda przynosi wiele korzyści. Rozwiązuje problemy związane z brakującymi lub nieprawidłowymi informacjami w obecnych bazach danych genów. Łącząc analizę dużych zbiorów danych z staranną ręczną weryfikacją, zmniejsza błędy ludzkie i pozwala odkryć więcej genów. Jest to kluczowe dla badania stresu oksydacyjnego, który jest powiązany z chorobami przewlekłymi, takimi jak Alzheimer, choroby serca, cukrzyca oraz Parkinson.

Zobacz również:

Dzisiaj · 00:03

Elektryczna stymulacja nerwów pomaga na ból i zmęczenie u pacjentów z długim COVID.

Wpływ jest znaczący. Dzięki lepszemu zrozumieniu działania chorób na poziomie molekularnym, naukowcy mogą badać mniej znane geny, aby zrozumieć mechanizmy chorób i opracować specyficzne terapie. W przypadku choroby Parkinsona, analiza genów takich jak NUPR1 i UHRF2 może odkryć nowe cele terapeutyczne, co daje nadzieję na skuteczniejsze metody leczenia.

Metoda ta nie ogranicza się tylko do stresu oksydacyjnego czy choroby Parkinsona. Może być stosowana w przypadku wielu innych schorzeń związanych z procesami utleniania. Podejście to może prowadzić do medycyny spersonalizowanej opartej na informacjach genetycznych, co skutkuje dokładniejszymi i bardziej skutecznymi terapiami dla różnych chorób.

Badacze Takayuki Suzuki i Hidemasa Bono, wspierani przez takie instytucje jak COI-NEXT oraz Japońska Agencja Nauki i Technologii, promują wykorzystanie tej metody do badania różnych chorób. Wspólna inicjatywa ma na celu rozwijanie badań genetycznych i skupienie się na genach, które wcześniej były pomijane.