AI voorspelt genetische gezondheidsrisico's met DeepRVAT-tools

Leestijd: 2 minuten
Door Jan Vaart
- in
DNA-streng met AI digitale interface-elementen

AmsterdamDeepRVAT is een innovatief deep learning-instrument dat helpt voorspellen hoe zeldzame genetische varianten de gezondheid beïnvloeden. Het is ontwikkeld door onderzoekers van het Duitse Kankeronderzoekscentrum, het Europees Laboratorium voor Moleculaire Biologie en de Technische Universiteit van München. Dit hulpmiddel biedt nauwkeurigere inschattingen van genen die beïnvloed worden door deze zeldzame varianten. Dit is belangrijk omdat, hoewel zeldzame varianten niet vaak voorkomen, ze een grote impact kunnen hebben op de kans op het ontwikkelen van ziekten.

DeepRVAT is getraind met gegevens van de UK Biobank, die informatie bevat van 161.000 personen en ongeveer 13 miljoen genetische varianten. Het algoritme onderzoekt individuele genetische details om te bekijken hoe zeldzame varianten eiwitten of cel functies kunnen beïnvloeden. Dit draagt bij aan een nauwkeurige inschatting van genetische risico's voor diverse gezondheidsproblemen, wat mogelijke verbeteringen biedt in gepersonaliseerde geneeskunde.

Deze technologie is cruciaal en kan aanzienlijke gevolgen hebben.

  • Verbeterde Voorspelling van Ziekterisico's: Door DeepRVAT te combineren met polygenetische risicoscores wordt de nauwkeurigheid van voorspellingen aanzienlijk verbeterd, vooral voor mensen met genetische hoogrisicoprofielen.
  • Ontdekking van Nieuwe Genetische Verbanden: Met DeepRVAT zijn genetische verbanden voor ziektes ontdekt die voorheen niet werden herkend, zoals hart- en vaatziekten en bepaalde soorten kanker.
  • Verbeterde Personalisatie in de Geneeskunde: Door genetische oorzaken te identificeren, helpt het instrument bij het op maat maken van behandelingen op individuele genetische samenstellingen, vooral in de oncologie.
  • Efficiëntie in Gegevensverwerking: Deze methode vereist minder rekenkracht dan eerdere technieken, wat het breder toepasbaar maakt.

DeepRVAT valt op vanwege zijn nauwkeurigheid in voorspellingen en de veelzijdigheid bij verschillende eigenschappen. Het kan worden gecombineerd met andere testmethoden, waardoor het nuttig is in diverse onderzoeks- en klinische situaties. Dit kan leiden tot vooruitgang in de behandeling van zeldzame vormen van kanker bij kinderen. Onderzoekers zijn van plan het te gebruiken in studies zoals INFORM, dat gepersonaliseerde behandelingen wil vinden voor kinderen van wie de kanker is teruggekeerd.

Integratie met platforms zoals het Duits Genoom-Fenoom Archief (GHGA) kan diagnostische en onderzoeksprocessen versnellen. Dankzij kunstmatige intelligentie komt de genomica steeds dichter bij het begrijpen van zeldzame genetische aandoeningen. Met de voortgang van technologie wordt het voorspellen van de effecten van genetische varianten eenvoudiger, wat leidt tot verbeterde gezondheidszorgoplossingen op basis van data.

De studie is hier gepubliceerd:

http://dx.doi.org/10.1038/s41588-024-01919-z

en de officiële citatie - inclusief auteurs en tijdschrift - is

Brian Clarke, Eva Holtkamp, Hakime Öztürk, Marcel Mück, Magnus Wahlberg, Kayla Meyer, Felix Munzlinger, Felix Brechtmann, Florian R. Hölzlwimmer, Jonas Lindner, Zhifen Chen, Julien Gagneur, Oliver Stegle. Integration of variant annotations using deep set networks boosts rare variant association testing. Nature Genetics, 2024; DOI: 10.1038/s41588-024-01919-z
Artificial Intelligence: Laatste nieuws

Deel dit artikel

Reacties (0)

Plaats een reactie
NewsWorld

NewsWorld.app is dé gratis premium nieuwssite van Nederland. Wij bieden onafhankelijk en kwalitatief hoogwaardig nieuws zonder daarvoor geld per artikel te rekenen en zonder abonnementsvorm. NewsWorld is van mening dat zowel algemeen, zakelijk, economisch, tech als entertainment nieuws op een hoog niveau gratis toegankelijk moet zijn. Daarbij is NewsWorld razend snel en werkt het met geavanceerde technologie om de nieuwsartikelen in een zeer leesbare en attractieve vorm aan te bieden aan de consument. Dus wil je gratis nieuws zonder betaalmuur (paywall), dan ben je bij NewsWorld aan het goede adres. Wij blijven ons inzetten voor hoogwaardige gratis artikelen zodat jij altijd op de hoogte kan blijven!


© 2024 NewsWorld™. Alle rechten voorbehouden.