Descubren raras células T y genes clave vinculados a trastornos inmunológicos
MadridCientíficos descubren nuevas y cruciales funciones del sistema inmunitario. Yasuhiro Murakawa y su equipo del Centro RIKEN para Ciencias Médicas Integrativas y la Universidad de Kyoto en Japón, junto con IFOM ETS en Italia, han identificado varios tipos raros de células T auxiliares. Estas células están vinculadas a trastornos inmunitarios como la esclerosis múltiple, la artritis reumatoide y el asma.
Los resultados fueron publicados el 4 de julio en la revista Science. Utilizando una nueva tecnología llamada ReapTEC, los investigadores identificaron potenciadores genéticos en tipos raros de células T vinculados a trastornos inmunitarios específicos. El nuevo atlas de células T derivado de esta investigación ahora está disponible públicamente.
Los linfocitos T ayudantes son células blancas esenciales para el sistema inmunológico. Detectan gérmenes y regulan las respuestas defensivas del cuerpo. Problemas en las funciones de estas células pueden causar diversas enfermedades inmunitarias. En enfermedades autoinmunes como la esclerosis múltiple, los linfocitos T atacan erróneamente al cuerpo. En las alergias, estos linfocitos reaccionan de forma exagerada a elementos inofensivos como el polen.
Antes conocíamos varios tipos comunes de células T. Estudios recientes han descubierto la existencia de células T raras y especializadas. Estos tipos poco comunes podrían estar relacionados con enfermedades inmunitarias.
Las células T tienen regiones en su ADN llamadas potenciadores. Estos potenciadores no producen proteínas, sino que generan pequeñas piezas de ARN y ayudan a aumentar la actividad de otros genes. Variaciones en el ADN de los potenciadores provocan cambios en la actividad genética, lo cual afecta el funcionamiento de las células T. Algunos potenciadores utilizan ambas cadenas del ADN para producir ARN potenciador.
Investigadores de RIKEN IMS y otros institutos desarrollaron la tecnología ReapTEC para identificar conexiones entre ciertos potenciadores de células T y enfermedades inmunitarias. Analizaron alrededor de un millón de células T humanas y descubrieron varios pequeños grupos de tipos raros de células T, que constituyen menos del 5 % del total.
Mediante el uso de ReapTEC, encontraron 63,000 potenciadores activos operando bidireccionalmente en estas raras células T.
Utilizaron estudios de asociación del genoma completo (GWAS) para investigar si estos potenciadores están relacionados con enfermedades inmunológicas. GWAS identifica variantes genéticas, conocidas como polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), que se asocian con diversas enfermedades del sistema inmune. Al combinar los datos de GWAS con los resultados de ReapTEC, encontraron una conexión.
- Las variantes genéticas relacionadas con enfermedades inmunomediadas a menudo se encuentran en potenciadores bidireccionales de células T raras.
- Las variantes genéticas para enfermedades neurológicas no mostraron el mismo patrón.
Existen ciertos potenciadores que funcionan en ambas direcciones, los cuales se encuentran en raras células T y están directamente relacionados con enfermedades inmunitarias.
Investigadores analizaron los datos y vincularon potenciadores específicos en células T raras con ciertas enfermedades autoinmunes. De los 63,000 potenciadores, encontraron 606 que tenían SNPs relacionados con 18 enfermedades inmunológicas distintas.
Descubrieron algunos genes que son activados por estos potenciadores relacionados con enfermedades. Por ejemplo, cuando se activó un potenciador con una variante genética vinculada a la enfermedad inflamatoria intestinal, se incrementó la expresión del gen IL7R.
Utilizando esta información, los científicos buscan comprender cómo los genes provocan enfermedades humanas relacionadas con el sistema inmunológico. Con el tiempo, esta investigación podría ayudar a desarrollar nuevos tratamientos para dichas enfermedades.
El estudio se publica aquí:
http://dx.doi.org/10.1126/science.add8394y su cita oficial - incluidos autores y revista - es
Akiko Oguchi, Akari Suzuki, Shuichiro Komatsu, Hiroyuki Yoshitomi, Shruti Bhagat, Raku Son, Raoul Jean Pierre Bonnal, Shohei Kojima, Masaru Koido, Kazuhiro Takeuchi, Keiko Myouzen, Gyo Inoue, Tomoya Hirai, Hiromi Sano, Yujiro Takegami, Ai Kanemaru, Itaru Yamaguchi, Yuki Ishikawa, Nao Tanaka, Shigeki Hirabayashi, Riyo Konishi, Sho Sekito, Takahiro Inoue, Juha Kere, Shunichi Takeda, Akifumi Takaori-Kondo, Itaru Endo, Shinpei Kawaoka, Hideya Kawaji, Kazuyoshi Ishigaki, Hideki Ueno, Yoshihide Hayashizaki, Massimiliano Pagani, Piero Carninci, Motoko Yanagita, Nicholas Parrish, Chikashi Terao, Kazuhiko Yamamoto, Yasuhiro Murakawa, Matteo Guerrini, Hiroaki Hatano, Kazuyoshi Ishigaki, Yuki Ishikawa, Shuichiro Komatsu, Michihiro Kono, Yasuhiro Murakawa, Masahiro Nakano, Akiko Oguchi, Raku Son, Akari Suzuki, Kazuhiro Takeuchi, Nao Tanaka, Chikashi Terao, Kohei Tomizuka, Kazuhiko Yamamoto, Soichiro Yoshino. An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases. Science, 2024; 385 (6704) DOI: 10.1126/science.add8394Compartir este artículo