Ny studie: rara T-celler och gener kopplade till immunstörningar som MS upptäckta

StockholmForskare har upptäckt viktig ny information om immunsystemet. Yasuhiro Murakawa och hans team vid RIKEN Center for Integrative Medical Sciences och Kyoto University i Japan, tillsammans med IFOM ETS i Italien, har identifierat flera sällsynta typer av hjälpar T-celler. Dessa celler är kopplade till immunstörningar som multipel skleros, reumatoid artrit och astma.

Resultaten publicerades den 4 juli i tidskriften Science. Med hjälp av en ny teknik som heter ReapTEC lyckades forskare identifiera genetiska förstärkare i sällsynta T-cellstyper kopplade till specifika immunstörningar. Den nya T-cellsatlasen från denna forskning är nu offentligt tillgänglig.

Hjälpar-T-celler är vita blodkroppar som är avgörande för immunsystemets funktion. De identifierar mikroorganismer och styr kroppens försvarsreaktioner. Störningar i T-cellernas funktion kan leda till olika immunsystemsjukdomar. Vid autoimmuna sjukdomar som multipel skleros attackerar T-celler felaktigt kroppens vävnader. Vid allergier reagerar T-celler alltför starkt på ofarliga ämnen som pollen.

Vi kände tidigare till flera vanliga T-celler. Nya studier visar nu att det finns sällsynta och specialiserade T-celler. Dessa sällsynta typer kan vara kopplade till immunsjukdomar.

T-celler, precis som alla celler, har delar av sitt DNA som kallas förstärkare. Förstärkare producerar inte proteiner. De bildar små RNA-bitar och bidrar till att öka aktiviteten hos andra gener. Skillnader i förstärkar-DNA orsakar förändringar i genaktiviteten, vilket påverkar hur T-celler fungerar. Vissa förstärkare använder båda DNA-strängarna för att producera förstärkar-RNA.

Forskare vid RIKEN IMS och andra institut har utvecklat ReapTEC-teknologi för att identifiera samband mellan vissa T cellsförstärkare och immunsjukdomar. De undersökte omkring en miljon mänskliga T celler och upptäckte flera små grupper av sällsynta T celltyper som utgör mindre än 5% av det totala antalet.

Med hjälp av ReapTEC upptäckte de 63 000 aktiva förstärkare som verkar i båda riktningarna i dessa sällsynta T-celler.

Läs också:

Idag · 02:08

Historisk fosteravård gav makt åt fattiga kvinnor

De använde genomomfattande associationsstudier (GWAS) för att undersöka om dessa förstärkare är kopplade till immunsjukdomar. GWAS identifierar genetiska varianter, kallade enkelnukleotidpolymorfier (SNP), som är associerade med olika immunsjukdomar. Genom att kombinera GWAS-data med ReapTEC-resultat fann de en koppling.

Genetiska varianter som är kopplade till immunmedierade sjukdomar återfinns ofta inom bidirektionella förstärkare hos sällsynta T-celler. Däremot visade genetiska varianter för neurologiska sjukdomar inte samma mönster.

Vissa förstärkare, som fungerar i båda riktningarna, finns i sällsynta T-celler och har en direkt koppling till immunsjukdomar.

Forskare undersökte data och kopplade specifika enhancers i sällsynta T-celler till vissa immunsjukdomar. Av de 63 000 enhancers som studerades fann de 606 som hade SNPs associerade med 18 olika immunrelaterade sjukdomar.

De upptäckte några gener som aktiveras av dessa sjukdomsrelaterade förstärkare. Till exempel, när en förstärkare med en genetisk variant kopplad till inflammatorisk tarmsjukdom blev aktiverad, orsakade det att IL7R-genen uttrycktes mer.

Genom att använda denna information strävar forskare efter att förstå hur gener leder till immunsystemrelaterade sjukdomar hos människor. Med tiden kan denna forskning bidra till att hitta nya behandlingar för dessa sjukdomar.