Nowe badanie: odkryto rzadkie limfocyty T i geny związane z zaburzeniami odporności.

Czas czytania: 3 minut
Przez Jamie Olivos
- w
Mikroskopijne spojrzenie na limfocyty T i kod genetyczny.

WarsawNaukowcy odkryli istotne nowe informacje na temat układu odpornościowego. Zespół Yasuhiro Murakawy z Centrum Badań Integracyjnych RIKEN oraz Uniwersytetu w Kioto w Japonii, we współpracy z IFOM ETS we Włoszech, zidentyfikował kilka rzadkich typów komórek T pomocniczych. Komórki te są związane z chorobami autoimmunologicznymi, takimi jak stwardnienie rozsiane, reumatoidalne zapalenie stawów i astma.

Wyniki badań zostały opublikowane 4 lipca w czasopiśmie Science. Dzięki nowej technologii o nazwie ReapTEC naukowcy zidentyfikowali genetyczne wzmacniacze w rzadkich typach komórek T związanych ze specyficznymi zaburzeniami układu odpornościowego. Nowy atlas komórek T z tych badań jest teraz publicznie dostępny.

Limfocyty T pomocnicze to białe krwinki, które odgrywają kluczową rolę w układzie odpornościowym. Ich zadaniem jest wykrywanie drobnoustrojów i kontrolowanie reakcji obronnych organizmu. Dysfunkcje limfocytów T mogą prowadzić do różnych chorób układu odpornościowego. W chorobach autoimmunologicznych, takich jak stwardnienie rozsiane, limfocyty T błędnie atakują własne tkanki organizmu. Natomiast w przypadku alergii reagują zbyt silnie na nieszkodliwe substancje, takie jak pyłki kwiatowe.

Kiedyś znaliśmy kilka powszechnych rodzajów komórek T. Najnowsze badania pokazują, że istnieją rzadkie i wyspecjalizowane komórki T. Te rzadkie typy mogą być powiązane z chorobami autoimmunologicznymi.

Limfocyty T, podobnie jak wszystkie komórki, posiadają fragmenty DNA zwane wzmacniaczami. Wzmacniacze nie kodują białek. Tworzą one małe cząstki RNA i pomagają zwiększyć aktywność innych genów. Różnice w DNA wzmacniaczy powodują zmiany w aktywności genów, co wpływa na funkcjonowanie limfocytów T. Niektóre wzmacniacze wykorzystują obie nici DNA do wytwarzania RNA wzmacniacza.

Naukowcy z RIKEN IMS oraz innych instytutów opracowali technologię ReapTEC, umożliwiającą wykrywanie powiązań pomiędzy określonymi wzmacniaczami komórek T a chorobami układu odpornościowego. Przeanalizowali około miliona ludzkich komórek T i odkryli kilka małych grup rzadkich typów komórek T, które stanowią mniej niż 5% całości.

Dzięki technologii ReapTEC odkryli 63 000 aktywnych wzmacniaczy działających w obu kierunkach w tych rzadkich komórkach T.

Przeprowadzili badania asocjacyjne całego genomu (GWAS), aby sprawdzić, czy te wzmacniacze są powiązane z chorobami autoimmunologicznymi. GWAS identyfikuje warianty genetyczne, zwane polimorfizmami pojedynczego nukleotydu (SNP), które są związane z różnymi chorobami autoimmunologicznymi. Łącząc dane z GWAS z wynikami ReapTEC, odkryli powiązanie.

Genetyczne warianty związane z chorobami autoimmunologicznymi często znajdują się w dwukierunkowych wzmacniaczach rzadkich komórek T. Natomiast warianty genetyczne związane z chorobami neurologicznymi nie wykazują takiej samej zależności.

Niektóre wzmacniacze, działające w obu kierunkach, występują w rzadkich komórkach T i mają bezpośredni związek z chorobami autoimmunologicznymi.

Naukowcy przeanalizowali dane i powiązali konkretne wzmacniacze w rzadkich komórkach T z niektórymi chorobami układu odpornościowego. Spośród 63 000 wzmacniaczy zidentyfikowali 606, które zawierały SNP powiązane z 18 różnymi chorobami związanymi z układem odpornościowym.

Odkryli, że niektóre geny są aktywowane przez wzmacniacze związane z chorobami. Na przykład, gdy wzmacniacz z wariantem genetycznym powiązanym z chorobą zapalną jelit został aktywowany, zwiększało to ekspresję genu IL7R.

Korzystając z tych informacji, naukowcy dążą do zrozumienia, w jaki sposób geny przyczyniają się do występowania chorób związanych z układem odpornościowym u ludzi. Z czasem badania te mogą pomóc w odkrywaniu nowych metod leczenia tych schorzeń.

Badanie jest publikowane tutaj:

http://dx.doi.org/10.1126/science.add8394

i jego oficjalne cytowanie - w tym autorzy i czasopismo - to

Akiko Oguchi, Akari Suzuki, Shuichiro Komatsu, Hiroyuki Yoshitomi, Shruti Bhagat, Raku Son, Raoul Jean Pierre Bonnal, Shohei Kojima, Masaru Koido, Kazuhiro Takeuchi, Keiko Myouzen, Gyo Inoue, Tomoya Hirai, Hiromi Sano, Yujiro Takegami, Ai Kanemaru, Itaru Yamaguchi, Yuki Ishikawa, Nao Tanaka, Shigeki Hirabayashi, Riyo Konishi, Sho Sekito, Takahiro Inoue, Juha Kere, Shunichi Takeda, Akifumi Takaori-Kondo, Itaru Endo, Shinpei Kawaoka, Hideya Kawaji, Kazuyoshi Ishigaki, Hideki Ueno, Yoshihide Hayashizaki, Massimiliano Pagani, Piero Carninci, Motoko Yanagita, Nicholas Parrish, Chikashi Terao, Kazuhiko Yamamoto, Yasuhiro Murakawa, Matteo Guerrini, Hiroaki Hatano, Kazuyoshi Ishigaki, Yuki Ishikawa, Shuichiro Komatsu, Michihiro Kono, Yasuhiro Murakawa, Masahiro Nakano, Akiko Oguchi, Raku Son, Akari Suzuki, Kazuhiro Takeuchi, Nao Tanaka, Chikashi Terao, Kohei Tomizuka, Kazuhiko Yamamoto, Soichiro Yoshino. An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases. Science, 2024; 385 (6704) DOI: 10.1126/science.add8394
Nauka: Najnowsze wiadomości
Czytaj dalej:

Udostępnij ten artykuł

Komentarze (0)

Opublikuj komentarz