새 연구: sCIRCLE, 단일세포 RNA 데이터 시각화를 혁신적으로 바꾸는 도구 소개

Seoul과학자들은 단일 세포 분석 데이터를 훨씬 더 쉽게 볼 수 있는 새로운 도구를 개발했습니다. 이 도구는 sCIRCLE로 불리며, Helmholtz RNA 기반 감염 연구소(HIRI)와 뷔르츠부르크-슈바인푸르트 응용 과학 대학(THWS)에서 개발되었습니다.

sCIRCLE의 주요 특징:

• 인터랙티브 3D 시각화
• 실시간 탐색 기능
• 풍부한 메타데이터 통합
• 다양한 필터와 설정 지원
• 가상 현실(VR) 호환성

항생제 내성은 전 세계적으로 큰 문제입니다. 박테리아가 어떻게 내성이 생기는지를 이해하는 것이 중요합니다. 단일 세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq)은 박테리아의 유전자 활동을 자세히 연구하는 데 도움을 줍니다. 그러나 이 방법이 생성하는 방대한 데이터는 시각화하고 분석하기가 어렵습니다.

sCIRCLE은 연구자들이 scRNA-seq 데이터를 쉽게 볼 수 있고 작업할 수 있도록 해줍니다. 연구자들은 실시간으로 다양한 관점에서 단일 세포를 세밀하게 관찰할 수 있습니다. 이는 그들이 관심 있는 특정 세포 그룹이나 유전자에 집중하는 데 도움이 됩니다.

히리 소속 계산 생물학자이자 토론토 대학교 교수인 라스 바퀴스트가 연구를 시작했습니다. 그는 이러한 도구를 만드는 데 있어 협업의 중요성을 강조했습니다. 또한, sCIRCLE이 데이터 세트를 함께 분석하거나 결과를 시각화하는 데 도움을 준다고 언급했습니다.

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sCIRCLE은 이제 가상현실(VR) 기능을 포함하여 기본적인 3D 데이터 시각화를 제공합니다. 팀은 향후 데이터 탐색을 위한 더욱 몰입감 있고 사용자 친화적인 가상 환경을 개발하여 이 기능을 개선할 계획입니다.

HIRI의 연구자들은 이 도구를 여러 번 시험해 보았습니다. 다양한 그룹으로부터 정보를 수집하고, 과정 중에 피드백을 제공했습니다. 이러한 협력은 과학계에서 호평을 받는 제품으로 이어졌습니다.

이 팀의 연구는 다양한 분야와 기관 간의 협력 필요성을 강조합니다. THWS의 인터랙티브 미디어 교수인 에리히 숄스는 바퀴스트와 함께 지거를 지도했습니다. 숄스는 데이터 분석을 위한 사용이 간편한 도구를 만들기 위한 시도가 이제 시작이라고 말하며 앞으로 더 많은 협력이 이루어지기를 바랍니다.

sCIRCLE은 단일 세포 데이터 시각화를 위한 획기적인 도구입니다. 사용이 간편하면서도 강력한 기능을 제공하여 대량 데이터 세트를 다루는 연구자들에게 유용합니다. 생물정보학과 디자인의 협업으로 기능적이면서도 시각적으로 매력적인 제품이 탄생했습니다. sCIRCLE의 개발은 향후 연구에 새로운 가능성을 열어주며, 이후에 더 발전된 도구의 출현을 가능하게 할 것입니다.