Forskare avslöjar sällsynta T-celler och viktiga gener kopplade till immunitetsstörningar

StockholmForskare har upptäckt sällsynta typer av hjälpar T-celler som är kopplade till immunstörningar. Denna viktiga upptäckt gjordes av forskare från RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Kyoto University och IFOM ETS i Italien. Deras resultat publicerades den 4 juli i tidskriften Science.

Hjälpar T-celler är en typ av vita blodkroppar som är viktiga för immunsystemet. Många problem med immunförsvaret uppstår när T-cellerna inte fungerar som de ska. Vid autoimmuna sjukdomar som multipel skleros angriper T-cellerna kroppen, och vid allergier reagerar de för kraftigt på ofarliga ämnen.

Forskarna använde en ny teknik som heter ReapTEC. Detta gjorde det möjligt för dem att identifiera genetiska förstärkare i sällsynta T-cellsundergrupper. Tekniken fann en koppling mellan dessa förstärkare och specifika immunsjukdomar. Några av de immunsjukdomar som är inblandade är:

• Multipel skleros
• Reumatoid artrit
• Astma

Inuti celler, inklusive T-celler, finns delar av DNA som kallas förstärkare. Dessa producerar inte proteiner utan istället små RNA-bitar. Förstärkare bidrar till att öka aktiviteten hos andra gener. Förändringar i dessa förstärkare kan påverka hur T-celler fungerar. Vissa förstärkare kan använda båda DNA-strängarna för att skapa RNA.

Forskarna undersökte omkring en miljon mänskliga T-celler och upptäckte flera sällsynta typer som utgjorde mindre än 5% av det totala antalet. Genom att använda ReapTEC identifierade de närmare 63 000 aktiva enhancers i dessa celler.

Läs också:

Idag · 15:52

Förbättra korallrevens hälsa genom vattenkvalitet i städerna

Teamet undersökte om några förstärkare hade kopplingar till immunsjukdomar. För detta använde de genomomfattande associationsstudier (GWAS). GWAS har identifierat många enkel-nukleotidpolymorfismer (SNPs) som är associerade med immunsjukdomar. Genom att kombinera GWAS-data med ReapTEC-resultat upptäckte de ett mönster. Genetiska varianter för immunsjukdomar fanns ofta i den bidirektionella förstärkar-DNA:t hos sällsynta T-celler. Genetiska varianter för neurologiska sjukdomar visade inte samma mönster.

Forskarna upptäckte vissa förstärkare i sällsynta T-celler som är kopplade till specifika immunsjukdomar. Av de 63 000 förstärkarna identifierade de 606 med SNP:er relaterade till 18 immunsjukdomar. De identifierade också några gener som påverkas av dessa sjukdomsrelaterade förstärkare.

Aktivering av en specifik del av DNA som är kopplad till inflammatorisk tarmsjukdom ökade aktiviteten hos IL7R-genen. Denna upptäckt kan hjälpa oss att bättre förstå de genetiska orsakerna till mänskliga immunsjukdomar.

Den nya T-cell-atlasen är nu tillgänglig för allmänheten. Den kan bidra till att utveckla nya läkemedel mot immunsjukdomar. Fler experiment planeras. Forskarna har som mål att upptäcka nya molekyler för att behandla immunrelaterade störningar.