Des cellules T rares et des gènes clés révélés : une avancée contre les troubles immunitaires

ParisDes chercheurs ont identifié des types rares de cellules T auxiliaires liés à des troubles immunitaires. Cette découverte cruciale a été faite par des scientifiques du RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, de l'université de Kyoto et de l'IFOM ETS en Italie. Leurs résultats ont été publiés le 4 juillet dans la revue Science.

Les lymphocytes T auxiliaires sont des globules blancs essentiels au bon fonctionnement du système immunitaire. De nombreux troubles immunitaires surviennent lorsque ces cellules ne fonctionnent pas correctement. Dans les maladies auto-immunes comme la sclérose en plaques, les lymphocytes T attaquent l'organisme. Dans le cas des allergies, ils réagissent de manière excessive à des substances inoffensives.

Les chercheurs ont utilisé une nouvelle technologie appelée ReapTEC, leur permettant d'identifier des amplificateurs génétiques dans des sous-types rares de cellules T. Cette technologie a révélé un lien entre ces amplificateurs et certains troubles immunitaires spécifiques. Parmi ces troubles, on retrouve :

• Sclérose en plaques
• Polyarthrite rhumatoïde
• Asthme

À l'intérieur des cellules, y compris les cellules T, il existe des segments d'ADN appelés enhancers. Ceux-ci ne produisent pas de protéines, mais génèrent plutôt de petits morceaux d'ARN. Les enhancers augmentent l'activité d'autres gènes. Des modifications de ces enhancers peuvent affecter le fonctionnement des cellules T. Certains enhancers peuvent utiliser les deux brins d'ADN pour fabriquer de l'ARN.

Les chercheurs ont examiné environ un million de lymphocytes T humains et ont découvert plusieurs types rares qui représentaient moins de 5% du total. Grâce à ReapTEC, ils ont identifié près de 63 000 amplificateurs actifs dans ces cellules.

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Le lien entre les enhancers et les maladies immunitaires

L'équipe a étudié les liens potentiels entre des enhancers et des maladies immunitaires. Pour ce faire, elle a utilisé des études d'association pangénomique (GWAS). Ces études ont identifié de nombreux polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) associés à des maladies immunitaires. En combinant les données des GWAS avec les résultats de ReapTEC, ils ont identifié un schéma récurrent. Les variants génétiques liés aux maladies immunitaires se situaient souvent dans l'ADN des enhancers bidirectionnels des cellules T rares, contrairement aux variants génétiques des maladies neurologiques qui ne suivaient pas ce modèle.

Les chercheurs ont découvert des activateurs spécifiques dans des cellules T rares associés à certaines maladies immunitaires. Parmi les 63 000 activateurs, ils ont identifié 606 avec des SNP liés à 18 maladies immunitaires. Ils ont également mis en évidence certains gènes influencés par ces activateurs liés aux maladies.

L'activation d'une zone précise de l'ADN associée à la maladie inflammatoire de l'intestin a augmenté l'activité du gène IL7R. Cette découverte pourrait nous aider à mieux comprendre les causes génétiques des troubles immunitaires humains.

La nouvelle cartographie des cellules T est désormais accessible au grand public. Elle pourrait contribuer au développement de nouveaux médicaments pour les maladies immunitaires. D'autres expériences sont prévues. Les chercheurs espèrent découvrir de nouvelles molécules pour traiter les troubles immunitaires.