Nowe badania: pora dnia może pomóc rozwiązać kryzys replikowalności w badaniach mikrobiomu jelitowego

WarsawNaukowcy z Uniwersytetu Kalifornijskiego w San Diego odkryli, że mikrobiom jelitowy zmienia się w zależności od pory dnia. Ich badanie, opublikowane w czasopiśmie Nature Metabolism, ujawniło, że różne mikroorganizmy są bardziej aktywne o różnych porach dnia, przy czym niektóre dominują rano, a inne wieczorem. Te zmiany mogą wpływać na spójność wyników badań nad mikrobiomem.

Naukowcy zidentyfikowali kilka czynników wpływających na mikrobiom jelitowy: dieta, warunki życia, aktywność fizyczna, pochodzenie matki oraz pora dnia.

Badanie wykazało, że pobieranie próbek o różnych porach dnia może dawać bardzo odmienne wyniki. Na przykład, próbka stolca pobrana podczas śniadania będzie się różnić od tej pobranej przed kolacją. Dr Amir Zarrinpar, gastroenterolog i profesor w Szkole Medycznej Uniwersytetu Kalifornijskiego w San Diego, wyjaśnił, że moment pobrania próbek może znacząco wpływać na to, jakie mikroby zostaną wykryte oraz w jaki sposób naukowcy interpretują swoje odkrycia dotyczące badań nad chorobą.

Zarrinpar wpadł na pomysł po rozmowie z kolegą. W laboratorium kolegi badacz nie mógł powtórzyć wyników osiągniętych przez poprzedniego pracownika. Odkryli, że problemem był moment pobierania próbek. Poprzednia osoba pobierała próbki rano, a obecny badacz robił to wieczorem. Ta różnica w czasie pobierania próbek uniemożliwiała uzyskanie takich samych wyników.

Zobacz również:

Dzisiaj · 11:55

Przełomowe odkrycie genetyczne ujawnia tajemnice blokad umysłowych

Problemy z replikacją stanowią wyzwanie w badaniach nad mikrobiomem, częściowo dlatego, że dziedzina ta obejmuje wiele różnych dyscyplin i trudno jest kontrolować wszystkie zmienne. Zarrinpar uważa, że określenie odpowiedniego momentu na pobieranie próbek może pomóc w rozwiązaniu tego problemu. Wyjaśnił, że aby skutecznie przekazywać nasze odkrycia, musimy zrozumieć, że różnice w wynikach mogą wynikać z czasu pobierania próbek. Obecnie trudno jest ustalić, czy tak jest.

Badanie to ma duże znaczenie dla badań nad mikrobiomami oraz innymi dziedzinami, takimi jak metabolizm. Naukowcy z różnych dyscyplin, na przykład z biologii cyrkadialnej, również potrzebują jasnych zasad dotyczących czasu pobierania próbek.

Zarrinpar zamierza opracować jasne zasady dotyczące tego, kiedy i w jaki sposób zbierać próbki. Będzie współpracował z innymi naukowcami, organizacjami finansującymi oraz redaktorami czasopism naukowych. Jego kolejne badanie skupi się na wpływie czasu na badania z udziałem ludzi, co jest trudniejsze do zarządzania.

Badanie zostało sfinansowane przez Narodowe Instytuty Zdrowia, Fundację Sorosa oraz Amerykańskie Stowarzyszenie Szpitali. Autorzy badania to Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, Roland A. Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight z Uniwersytetu Kalifornijskiego w San Diego oraz Vanessa A. Leone z Uniwersytetu Wisconsin-Madison.