Nieuwe ontdekking: tijdstip van de dag cruciaal voor het oplossen van replicatieproblemen in microbiomonderzoek

AmsterdamWetenschappers van de Universiteit van Californië, San Diego ontdekten dat het darmmicrobioom verandert afhankelijk van het tijdstip van de dag. Hun onderzoek, gepubliceerd in Nature Metabolism, toonde aan dat verschillende micro-organismen op verschillende momenten actiever zijn, waarbij sommige 's ochtends domineren en andere 's avonds. Deze variatie kan de consistentie van resultaten in microbiome onderzoek beïnvloeden.

Wetenschappers hebben verschillende factoren vastgesteld die de darmmicrobiota beïnvloeden:

• Voeding
• Leefomstandigheden
• Lichaamsbeweging
• Moederlijke lijn
• Tijdstip van de dag

Uit de studie blijkt dat het tijdstip van het verzamelen van monsters gedurende de dag het resultaat aanzienlijk kan beïnvloeden. Zo verschilt een ontlastingsmonster genomen tijdens het ontbijt van een dat vlak voor het avondeten is afgenomen. Dr. Amir Zarrinpar, een gastro-enteroloog en professor aan de UC San Diego School of Medicine, legde uit dat het moment van monsterverzameling van grote invloed kan zijn op welke microben worden gevonden en hoe wetenschappers hun bevindingen interpreteren met betrekking tot de onderzochte ziekte.

Zarrinpar kreeg het idee na een gesprek met een collega. Een onderzoeker in het lab van de collega kon de resultaten van een eerdere medewerker niet reproduceren. Ze ontdekten dat het probleem lag aan het moment waarop de monsters werden genomen. De vorige persoon nam 's ochtends monsters, terwijl de huidige onderzoeker ze 's avonds nam. Dit tijdstipverschil zorgde ervoor dat dezelfde resultaten niet behaald konden worden.

Lees ook:

Vandaag · 13:52

Doorbraak in behandeling van hartritmestoornissen ontdekt

Reproductieproblemen hebben het microbiologisch onderzoek bemoeilijkt, gedeeltelijk omdat het veld zoveel verschillende disciplines omvat en het lastig is om alle variabelen te beheersen. Zarrinpar denkt dat het weten wanneer je monsters moet verzamelen, kan helpen dit probleem op te lossen. Hij legde uit dat om onze bevindingen effectief te communiceren, we moeten beseffen dat verschillende resultaten kunnen worden veroorzaakt door het tijdstip van monsterafname. Op dit moment is het moeilijk om vast te stellen of dit inderdaad het geval is.

Deze studie is cruciaal voor onderzoek naar microbiomen en andere gebieden zoals de stofwisseling. Ook onderzoekers uit diverse disciplines, bijvoorbeeld in de circadiane biologie, hebben behoefte aan duidelijke richtlijnen over het tijdstip van monsterafname.

Zarrinpar is van plan om duidelijke richtlijnen op te stellen voor het verzamelen van monsters. Hij zal samenwerken met andere wetenschappers, financieringsorganisaties en redacteuren van wetenschappelijke tijdschriften. Zijn volgende studie onderzoekt de invloed van timing op menselijk onderzoek, wat moeilijker te beheren is.

De studie werd gefinancierd door de National Institutes of Health, de Soros Foundation en de American Hospital Association. De auteurs van de studie zijn Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, Roland A. Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Pieter C. Dorrestein en Rob Knight van de University of California San Diego, en Vanessa A. Leone van de University of Wisconsin-Madison.