新研究:時間帯が腸内細菌研究の再現性問題解決の鍵かも知れない

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によって Jamie Olivos
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研究論文に重ねられた時計と腸内細菌

Tokyoカリフォルニア大学サンディエゴ校の科学者たちは、腸内細菌叢が時間帯によって変化することを発見しました。彼らの研究はNature Metabolism誌に発表され、異なる微生物が異なる時間に活動的になることを明らかにしました。例えば、朝に優勢なものもあれば、夕方に優勢になるものもあります。この変動は、腸内細菌叢の研究における結果の一貫性に影響を及ぼす可能性があります。

科学者たちは腸内フローラに影響を与えるいくつかの要因を特定しました。これには、食事、生活環境、運動習慣、母系遺伝、および一日の時間帯が含まれます。

異なる時間帯にサンプルを収集することで、非常に異なる結果が得られることが研究で明らかになりました。たとえば、朝食時に採取した便サンプルは夕食前に採取したものとは異なります。UCサンディエゴの医学部に所属する胃腸科医で教授のアミール・ザリンパー博士は、サンプルを採取する時間が、どのような微生物が見つかるかや、研究対象の病気についての科学者の解釈に大きな影響を与える可能性があると説明しました。

研究者たちは、自分たちの研究を含む過去の研究をコンピューターを使って分析しました。その結果、腸内細菌叢の変化が時間帯によって、食事によって引き起こされる変化と同じくらい重要であることを発見しました。Zarrinparは「マウスが朝食をとったわずか4時間後には、腸内細菌叢の約80パーセントが異なるものになることがわかりました」と述べています。

同僚との会話の後、ザリンパーはあるアイデアを思いつきました。どうやら、同僚の研究室の研究者が以前の研究者の結果を再現できないことが判明しました。それは、サンプルを採取する時間が原因でした。前任者は朝にサンプルを取っていましたが、現在の研究者は夕方に取っていました。この時間の違いが同じ結果を得ることを困難にしていたようです。

微生物研究では、様々な学問分野が関わり、全ての変数を管理することが難しいため、再現性の問題が生じています。ザリンパール氏は、サンプルを収集する適切なタイミングを知ることがこの問題解決につながると考えています。彼は、成果を効果的に伝えるためには、異なる結果がサンプル収集の時間に起因する可能性があることを認識する必要があると説明しています。しかし、現時点ではそれを判断することが難しい状況です。

この研究はマイクロバイオームや代謝といった分野の研究にとって重要です。例えば、概日リズム生物学などの異なる分野の科学者たちも、サンプルの採取時間に関する明確な指針を必要としています。

ザリンパル氏は、サンプル収集のタイミングや方法に関する明確なルールを策定する予定です。彼は他の科学者や資金提供団体、学術雑誌の編集者とも協力する予定です。次の研究では、タイミングが人間の研究に与える影響に焦点を当てる予定ですが、それは管理がより困難です。

この研究は、アメリカ国立衛生研究所、ソロス財団、アメリカ病院協会によって資金提供されました。研究の著者には、カリフォルニア大学サンディエゴ校のセレステ・アラバンド、アムリヤ・リンガラジュ、ステファニー・フローレス・ラモス、ターニャ・クマール、ハニエ・ジャバヘリ、マリア・D.・ティウ、アナ・カロリーナ・ダンタス・マシャド、ローランド・A・リヒター、エマニュエル・エリヤ、ガブリエル・G・ハダッド、ピーテル・C・ドレスタインと、ウィスコンシン大学マディソン校のヴァネッサ・A・レオーネが含まれています。

この研究はこちらに掲載されています:

http://dx.doi.org/10.1038/s42255-024-01064-1

およびその公式引用 - 著者およびジャーナルを含む - は

Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, R. Alexander Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Vanessa A. Leone, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight, Amir Zarrinpar. Time of sample collection is critical for the replicability of microbiome analyses. Nature Metabolism, 2024; DOI: 10.1038/s42255-024-01064-1
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