Nuova ricerca: l'ora del giorno potrebbe risolvere la crisi di replicabilità del microbioma

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Di Giovanni Dosa
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Orologio e batteri intestinali sovrapposti su un articolo di ricerca.

RomeScienziati dell'Università della California a San Diego hanno scoperto che il microbioma intestinale varia a seconda del momento della giornata. Il loro studio, pubblicato su Nature Metabolism, ha rivelato che diversi microrganismi sono più attivi in determinati orari, con alcuni che predominano al mattino e altri alla sera. Questa variazione può influenzare la consistenza dei risultati nelle ricerche sul microbioma.

Scienziati hanno individuato diversi fattori che influenzano il microbioma intestinale:

  • Dieta
  • Condizioni di vita
  • Esercizio fisico
  • Linea materna
  • Orario della giornata

Lo studio ha rivelato che raccogliere campioni in diversi momenti della giornata può portare a risultati molto vari. Per esempio, un campione di feci prelevato a colazione sarà diverso da uno raccolto prima di cena. Il dottor Amir Zarrinpar, gastroenterologo e professore alla UC San Diego School of Medicine, ha spiegato che il momento della raccolta dei campioni può influenzare notevolmente quali microbi vengono trovati e come gli scienziati interpretano i loro risultati riguardo alla malattia studiata.

Zarrinpar ha avuto un'intuizione dopo aver parlato con un collega. Un ricercatore nel laboratorio del collega non riusciva a replicare i risultati di una persona che aveva lavorato lì prima. Hanno scoperto che il problema era dovuto al momento in cui venivano prelevati i campioni. La persona precedente li prendeva al mattino, mentre l'attuale ricercatore li prendeva alla sera. Questa differenza di tempistica rendeva impossibile ottenere gli stessi risultati.

Questioni di replicazione nel campo della ricerca sul microbioma sono emerse in parte perché coinvolge molte discipline diverse ed è difficile controllare tutte le variabili. Zarrinpar ritiene che sapere quando raccogliere i campioni possa aiutare a risolvere questo problema. Ha spiegato che per comunicare i nostri risultati in modo efficace, dobbiamo renderci conto che differenti risultati potrebbero essere dovuti al momento della raccolta dei campioni. Al momento, è difficile stabilire se questo sia il caso.

Questo studio è cruciale per la ricerca sui microbiomi e su altri settori come il metabolismo. Anche gli scienziati di discipline diverse, come la biologia circadiana, desiderano linee guida precise sui tempi di raccolta dei campioni.

Zarrinpar intende stabilire regole precise per la raccolta dei campioni, collaborando con altri scienziati, enti finanziatori e redattori di riviste. Il suo prossimo studio esaminerà come il tempismo influisce sugli studi sull'uomo, che risultano essere più complessi da gestire.

Lo studio è stato finanziato dal National Institutes of Health, dalla Fondazione Soros e dall'Associazione Ospedaliera Americana. Tra gli autori della ricerca troviamo Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, Roland A. Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight dell'Università della California a San Diego e Vanessa A. Leone dell'Università del Wisconsin-Madison.

Lo studio è pubblicato qui:

http://dx.doi.org/10.1038/s42255-024-01064-1

e la sua citazione ufficiale - inclusi autori e rivista - è

Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, R. Alexander Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Vanessa A. Leone, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight, Amir Zarrinpar. Time of sample collection is critical for the replicability of microbiome analyses. Nature Metabolism, 2024; DOI: 10.1038/s42255-024-01064-1
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