Desvendando os mistérios dos genes saltadores: como DDM1 controla o genoma da Arabidopsis

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Por Alex Morales
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"Destaque da interação da proteína DDM1 com genes na cadeia de DNA"

São PauloPesquisadores Akihisa Osakabe e Yoshimasa Takizawa da Universidade de Tóquio descobriram como a proteína DDM1 controla certos genes móveis na planta Arabidopsis thaliana. Suas descobertas ajudam a entender condições genéticas em humanos causadas por mutações semelhantes em genes móveis, devido a uma proteína relacionada chamada HELLS.

DDM1 ajuda a manter os "genes saltadores" inativos, facilitando a cobertura desses genes com substâncias químicas que impedem sua leitura. Essas substâncias evitam que os "genes saltadores" se movimentem pelo genoma. Compreender a função do DDM1 é crucial, pois esses genes podem causar grandes mudanças no código genético, que podem ser tanto benéficas quanto prejudiciais.

Principais descobertas da pesquisa:

  • DDM1 acessa transposons dentro dos nucleossomos.
  • A criomicroscopia eletrônica foi utilizada para visualizar as estruturas.
  • Os locais de ligação do DDM1 no DNA foram identificados dentro dos nucleossomos.
  • DDM1 torna o nucleossomo mais flexível, permitindo que marcas químicas suprimam a transcrição de transposons.

Utilizando a criomicroscopia eletrônica, os pesquisadores conseguiram capturar imagens detalhadas. Isso permitiu que observassem a estrutura da DDM1 e sua interação com o DNA envolvido em nucleossomos. Eles notaram que a DDM1 abre o nucleossomo, permitindo a adição de marcadores químicos que suprimem a atividade gênica.

O estudo revelou que a proteína DDM1 se liga a certas áreas do DNA dentro do nucleossomo. Normalmente, essas áreas permanecem fechadas, mas se tornam mais flexíveis, facilitando a fixação de marcas químicas que bloqueiam a atividade dos genes. Essas marcas impedem que os transposons, também conhecidos como "genes saltadores", sejam copiados.

Esta pesquisa é crucial porque o HELLS, a versão humana do DDM1, opera de maneira semelhante. As descobertas nesta área podem ajudar a desenvolver novos tratamentos para doenças genéticas causadas por mutações em genes. Além disso, entender como plantas e outros organismos gerenciam seu DNA pode resultar em melhores safras ou novas tecnologias.

Os genes saltadores são fascinantes porque podem provocar alterações significativas no genoma, disse Osakabe. Estudar proteínas como a DDM1 nos ajuda a compreender processos essenciais da vida e pode trazer benefícios práticos importantes.

Osakabe e Takizawa conseguiram avanços significativos na pesquisa genética. Eles detalharam como o DDM1 regula os "genes saltadores," o que aprimorou nosso conhecimento sobre a genética das plantas. Esse entendimento pode abrir caminho para novas estratégias na melhoria da saúde humana e na agricultura. Além disso, essas descobertas podem facilitar o tratamento e a gestão de condições genéticas.

O estudo é publicado aqui:

http://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-49465-w

e sua citação oficial - incluindo autores e revista - é

Akihisa Osakabe, Yoshimasa Takizawa, Naoki Horikoshi, Suguru Hatazawa, Lumi Negishi, Shoko Sato, Frédéric Berger, Tetsuji Kakutani, Hitoshi Kurumizaka. Molecular and structural basis of the chromatin remodeling activity by Arabidopsis DDM1. Nature Communications, 2024; 15 (1) DOI: 10.1038/s41467-024-49465-w
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