Scoperto il ruolo cruciale di DDM1: come i geni 'saltatori' vengono controllati

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Di Fedele Bello
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"Filamento di DNA che evidenzia l'interazione della proteina DDM1 con i geni"

RomeRicercatori dell'Università di Tokyo, Akihisa Osakabe e Yoshimasa Takizawa, hanno scoperto il modo in cui la proteina DDM1 regola alcuni geni mobili nella pianta Arabidopsis thaliana. Questi risultati aiutano a comprendere le condizioni genetiche negli esseri umani causate da mutazioni simili dei geni mobili, influenzate da una proteina correlata chiamata HELLS.

DDM1 tiene inattivi i "geni saltellanti" rendendoli più facili da coprire con sostanze chimiche che impediscono loro di essere letti. Queste sostanze chimiche bloccano il movimento dei "geni saltellanti" nel genoma. Comprendere il ruolo di DDM1 è cruciale perché questi geni possono provocare cambiamenti significativi nel codice genetico, che possono essere sia benefici che dannosi.

Principali scoperte della ricerca:

  • DDM1 interagisce con i trasposoni all'interno dei nucleosomi.
  • La microscopia crio-elettronica è stata impiegata per analizzare le strutture.
  • I siti di legame di DDM1 sul DNA sono stati individuati nei nucleosomi.
  • DDM1 rende il nucleosoma più flessibile, permettendo ai marcatori chimici di sopprimere la trascrizione dei trasposoni.

I ricercatori hanno utilizzato la criomicroscopia elettronica per ottenere immagini dettagliate. Questo ha permesso loro di osservare la struttura di DDM1 e il suo modo di interagire con il DNA avvolto intorno ai nucleosomi. Hanno notato che DDM1 apre il nucleosoma, consentendo l’aggiunta di marcatori chimici che sopprimono l'attività genetica.

Questa ricerca è fondamentale perché HELLS, l'equivalente umano di DDM1, ha una funzione simile. Le scoperte in questo campo potrebbero portare a nuovi trattamenti per malattie genetiche causate da mutazioni. Inoltre, comprendere come piante e altri organismi gestiscono il loro DNA potrebbe favorire lo sviluppo di colture migliori o nuove tecnologie.

I geni “saltanti” sono affascinanti perché possono causare cambiamenti significativi nel genoma, ha spiegato Osakabe. Studiare proteine come la DDM1 ci aiuta a comprendere i processi vitali di base e può offrire benefici pratici significativi.

Il lavoro di Osakabe e Takizawa ha rappresentato un significativo passo avanti nella ricerca genetica. Hanno spiegato come DDM1 controlli i "geni saltellanti", permettendoci di comprendere meglio la genetica delle piante. Queste conoscenze potrebbero portare a nuovi metodi per migliorare la salute umana e l'agricoltura. La loro ricerca potrebbe inoltre aiutarci a gestire e trattare più efficacemente le condizioni genetiche.

Lo studio è pubblicato qui:

http://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-49465-w

e la sua citazione ufficiale - inclusi autori e rivista - è

Akihisa Osakabe, Yoshimasa Takizawa, Naoki Horikoshi, Suguru Hatazawa, Lumi Negishi, Shoko Sato, Frédéric Berger, Tetsuji Kakutani, Hitoshi Kurumizaka. Molecular and structural basis of the chromatin remodeling activity by Arabidopsis DDM1. Nature Communications, 2024; 15 (1) DOI: 10.1038/s41467-024-49465-w
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