Nowe badanie: AI Candycrunch szybko wykrywa raka, analizując cukry, co może zmienić diagnostykę.

Czas czytania: 2 minut
Przez Jamie Olivos
- w
Sztuczna inteligencja analizująca cukry szybko ujawnia komórki nowotworowe.

WarsawNaukowcy z Uniwersytetu w Göteborgu opracowali narzędzie AI, które ma na celu ulepszenie wykrywania raka poprzez badanie glikanów. Glikany, czyli grupy cząsteczek cukru w naszych komórkach, mogą wskazywać na różne typy nowotworów. Obecnie do mierzenia glikanów używana jest spektrometria masowa, jednak analiza wymaga pracy ręcznej. Ten manualny proces jest powolny i zajmuje od kilku godzin do kilku dni na próbkę. Jedynie nieliczni eksperci na świecie potrafią przeprowadzać takie analizy z wysoką precyzją.

Zespół wprowadził model AI o nazwie Candycrunch, aby zautomatyzować ten manualny proces. Model AI rozwiązuje to zadanie w ciągu kilku sekund. Wyniki badań zostały opublikowane w czasopiśmie Nature Methods. Nowa metoda polega na trenowaniu AI z wykorzystaniem bazy danych, która zawiera:

  • Ponad 500 000 przykładów różnych fragmentacji glikanów
  • Powiązane struktury cząsteczek cukrów

Candycrunch potrafi określić strukturę cukru w próbce z 90% dokładnością. Daniel Bojar, wykładowca bioinformatyki na Uniwersytecie w Göteborgu, stwierdza, że ta dokładność jest porównywalna do innych analiz sekwencji biologicznych, takich jak DNA, RNA czy białka.

Szybki model SI sprawnie identyfikuje markery glikanowe, które wspomagają diagnozowanie i prognozowanie nowotworów. Automatyzacja w Candycrunch ułatwia te analizy glikanów, co może spowodować ich częstsze wykorzystanie w badaniach biologicznych i klinicznych.

Candycrunch potrafi dostrzegać struktury, które często umykają tradycyjnym analizom ze względu na ich niską obecność. Ta umiejętność pozwala naukowcom odkrywać nowe biologiczne markery związane z glikanami. Daniel Bojar uważa, że postęp ten przyczyni się do częstszego wykorzystania analizy glikanów w badaniach nad rakiem i w innych dziedzinach.

W przeszłości analiza glikanów ręcznie była czasochłonna i utrudniała wykrywanie nowotworów, zwłaszcza przy dużej liczbie próbek. Obecnie model AI może przetwarzać dane szybko, co przyspiesza pracę i zwiększa jej dokładność. Ta automatyzacja ułatwia wykrywanie oznak nowotworów.

Model AI działa szybko i precyzyjnie, co umożliwia sprawdzanie większej liczby próbek w krótszym czasie. Przed pojawieniem się Candycrunch takie szczegółowe prace mogli wykonywać tylko nieliczni specjaliści. Dzięki automatyzacji tego procesu istnieje większa szansa na wczesne wykrycie raka, co jest kluczowe dla leczenia i wyników terapii.

Nowy model AI opracowany przez Uniwersytet w Göteborgu, Candycrunch, znacznie przyspiesza i czyni bardziej niezawodnym analizę glikanów w kontekście wykrywania nowotworów. Ta metoda minimalizuje również zależność od ludzkiej wiedzy specjalistycznej, co przynosi znaczące korzyści dla badań nad rakiem i jego leczeniem.

Badanie jest publikowane tutaj:

http://dx.doi.org/10.1038/s41592-024-02314-6

i jego oficjalne cytowanie - w tym autorzy i czasopismo - to

James Urban, Chunsheng Jin, Kristina A. Thomsson, Niclas G. Karlsson, Callum M. Ives, Elisa Fadda, Daniel Bojar. Predicting glycan structure from tandem mass spectrometry via deep learning. Nature Methods, 2024; DOI: 10.1038/s41592-024-02314-6
Sztuczna Inteligencja: Najnowsze wiadomości

Udostępnij ten artykuł

Komentarze (0)

Opublikuj komentarz