Nieuwe doorbraak: AI ontrafelt kankersporen razendsnel met CandyCrunch

AmsterdamOnderzoekers van de Universiteit van Göteborg hebben een AI-tool ontwikkeld om kanker beter te detecteren door glycanen te bestuderen. Glycanen, groepen suiker moleculen in onze cellen, kunnen verschillende soorten kanker signaleren. Momenteel wordt massaspectrometrie gebruikt om glycanen te meten, maar de analyse moet handmatig worden uitgevoerd. Dit handmatige werk is traag en duurt per monster van enkele uren tot enkele dagen. Slechts een paar experts wereldwijd kunnen deze analyses met hoge nauwkeurigheid uitvoeren.

Het team heeft een AI-model genaamd Candycrunch ontwikkeld om dit handmatige proces te automatiseren. Binnen enkele seconden lost het model de taak op. De resultaten zijn gepubliceerd in het tijdschrift Nature Methods. De nieuwe methode omvat het trainen van de AI met een database die bestaat uit:

• Meer dan 500.000 voorbeelden van verschillende glycan fragmentaties
• Bijbehorende structuren van suikermoleculen

Candycrunch kan met een nauwkeurigheid van 90% de suikerstructuur in een monster bepalen. Daniel Bojar, een bio-informatica docent aan de Universiteit van Göteborg, zegt dat deze nauwkeurigheid vergelijkbaar is met andere biologische sequentieanalyses, zoals DNA, RNA of eiwitten.

Het snelle AI-model identificeert razendsnel biomerkers op basis van glycaan, wat helpt bij de diagnose en voorspelling van kanker. Door de automatisering van Candycrunch worden deze glycan-analyses eenvoudiger, waardoor ze vaker kunnen worden gebruikt in biologisch en klinisch onderzoek.

Lees ook:

21 november 2024 · 08:55

Nvidia imponeert, maar Aziatische beurs reageert aarzelend op concurrentie.

Candycrunch kan structuren detecteren die vaak over het hoofd worden gezien in menselijke analyses omdat ze slechts in kleine hoeveelheden aanwezig zijn. Deze mogelijkheid helpt onderzoekers nieuwe biologische merkers gerelateerd aan glycanen te ontdekken. Daniel Bojar gelooft dat deze vooruitgang het gebruik van glycanenanalyse in kankeronderzoek en andere gebieden zal vergroten.

In het verleden was het handmatig analyseren van glycans traag en bemoeilijkte het de opsporing van kanker, vooral bij veel monsters. Nu kan een AI-model de gegevens snel verwerken, wat het werk sneller en nauwkeuriger maakt. Deze automatisering helpt bij het gemakkelijker vinden van kankertekens.

Het AI-model werkt snel en nauwkeurig, waardoor meer monsters sneller kunnen worden gecontroleerd. Voor Candycrunch konden slechts enkele experts dit gedetailleerde werk doen. Door het proces te automatiseren, is de kans om kanker vroegtijdig op te sporen groter, wat essentieel is voor de behandeling en het resultaat.

Het nieuwe AI-model van de Universiteit van Göteborg, Candycrunch, maakt de analyse van glycaanen voor kankerdetectie sneller en betrouwbaarder. Deze methode vereist ook minder menselijke expertise. Het biedt aanzienlijke verbeteringen voor kankeronderzoek en -behandeling.