Nouveaux secrets génétiques : contrôler les « gènes sauteurs » avec DDM1 dans Arabidopsis thaliana

Temps de lecture: 2 minutes
Par Madelaine Dupont
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Arabette avec protéine DDM1 mise en évidence contrôlant la génétique

ParisVoici les points essentiels de l'étude :

  • DDM1 rend les transposons accessibles aux marques chimiques qui suppriment la transcription.
  • Les transposons sont des séquences génétiques qui peuvent se déplacer dans le génome.
  • DDM1 se lie à l'ADN dans le nucléosome et l'ouvre.
  • Cette flexibilité du site de liaison permet le dépôt de marques chimiques, interrompant ainsi la transcription.

DDM1 aide à maintenir certaines portions de l'ADN, appelées transposons, inactives en leur ajoutant des marques chimiques. Les scientifiques ne comprenaient pas entièrement le mécanisme de DDM1, d'autant plus que les transposons se trouvent généralement dans les nucléosomes. Les nucléosomes sont des structures où l'ADN est enroulé de manière serrée autour de protéines nommées histones. Cet enroulement rend difficile pour les cellules l'accès aux transposons afin de leur attribuer ces marques suppressives.

Grâce à la microscopie cryo-électronique, une méthode d'imagerie précise, les chercheurs ont pu observer la structure de DDM1 et de l'ADN dans le nucléosome. Osakabe a souligné que l'une des découvertes les plus fascinantes concernait la manière dont DDM1 interagit avec le nucléosome. Cette observation était cruciale car elle a révélé les zones spécifiques où DDM1 se fixe, rendant le nucléosome suffisamment flexible pour permettre des modifications chimiques.

Cette découverte est cruciale car elle dévoile des processus biologiques fondamentaux et possède des applications pratiques. Comprendre DDM1 permet de s'attaquer aux maladies génétiques causées par des mutations chez les humains. La version humaine de DDM1, appelée HELLS, fonctionne de manière similaire. Cette recherche pourrait éventuellement conduire à de nouveaux traitements pour les troubles génétiques.

Ces connaissances peuvent se révéler précieuses dans l’agriculture et la biotechnologie. Les scientifiques pourraient manipuler le fonctionnement de l'ADN chez les plantes pour augmenter les récoltes et développer de nouvelles applications biotechnologiques. Les enseignements tirés de cette recherche nous montrent comment les êtres vivants gèrent leur ADN, ouvrant la voie à des avancées dans de nombreux domaines.

Comprendre ces minuscules structures et déchiffrer leurs détails révèle à quel point les systèmes biologiques peuvent être complexes et précis. Il est passionnant de penser aux nouvelles possibilités que ces découvertes pourraient offrir en génétique et dans d'autres domaines.

L'étude est publiée ici:

http://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-49465-w

et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est

Akihisa Osakabe, Yoshimasa Takizawa, Naoki Horikoshi, Suguru Hatazawa, Lumi Negishi, Shoko Sato, Frédéric Berger, Tetsuji Kakutani, Hitoshi Kurumizaka. Molecular and structural basis of the chromatin remodeling activity by Arabidopsis DDM1. Nature Communications, 2024; 15 (1) DOI: 10.1038/s41467-024-49465-w
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