Ny studie: revolutionerande Telo-seq-teknik förvandlar forskning om telomerer vid åldrande och cancer

StockholmForskare vid Salk Institute har utvecklat ett nytt verktyg som heter Telo-seq. Det här verktyget kommer att förbättra vår förmåga att studera telomerer i samband med åldrande och sjukdomar. Telomerer är sektioner i ändarna av våra kromosomer som förkortas när vi åldras, vilket kan leda till celldöd när de blir för korta.

Telo-seq förfinar äldre metoder. Det här gör den bättre:

• Den sekvenserar hela telomererna
• Den mäter telomerlängden på varje kromosom
• Den ger data med hög upplösning

Jan Karlseder, huvudforskaren, säger att äldre metoder inte gav tydliga resultat. Tidigare kunde forskare endast spekulera om hur telomerer påverkar åldrande och cancer. Men nu, med Telo-seq, kan de testa sina teorier direkt.

Karlseder och hans team samarbetade med Oxford Nanopore Technologies och använde långläst sekvensering tillsammans med ny biokemi och bioinformatikmetoder. Telo-seq börjar vid slutet av varje telomer och sekvenserar in i den subtelomera regionen. Detta hjälper forskare att identifiera kromosomen och undersöka strukturen och sammansättningen av telomerer.

Forskare som använder Telo-seq har upptäckt att längderna på telomererna varierar mellan olika kromosomarmar. De fann också att hastigheten på telomerförkortning kan skilja sig även hos en individ. Detta kan bero på faktorer som stress och inflammation. Olika vävnader och celler har olika hastigheter av telomerförkortning, vilket innebär att det kan finnas specifika faktorer för varje kromosom.

Karlseder är nyfiken på hur olika hastigheter av telomerförkortning bland människor och kromosomer påverkar åldrandet. Han tror att en förståelse för dessa skillnader kan hjälpa oss stötta ett hälsosamt åldrande. Telo-seq kommer också att hjälpa oss att lära oss mer om sjukdomar relaterade till telomerer.

Läs också:

Idag · 07:29

AR blir smartglasögon för fler användningsområden

Vissa sjukdomar, kallade telomeropatier, uppstår när stamceller förlorar sina telomerer. Detta kan leda till håravfall, problem med immunsystemet eller vissa typer av cancer. Telo-seq är en metod som hjälper forskare att avgöra om dessa sjukdomar är ärftliga eller kopplade till specifika kromosomer. Denna forskning kan bidra till att utveckla specifika behandlingar för dessa sjukdomar.

Både korta och långa telomerer kan orsaka problem. När telomerreparationen är överaktiv kan cancerceller dela sig obegränsat. För att bevara telomererna använder cellerna antingen enzymet telomeras eller en annan metod som kallas ALT, och varje metod skapar olika telomerstrukturer. Före Telo-seq var det svårt att mäta dessa skillnader.

Tobias Schmidt, en forskare, säger att Telo-seq kan avgöra om en cancer använder telomeras eller ALT. Detta är viktigt eftersom cancer som använder ALT ofta är mer aggressiva och kräver annan behandling. Telo-seq kan snabbt hjälpa läkare att välja rätt behandling för varje patient.

Studieförfattarna anser att Telo-seq kommer att revolutionera telomerforskningen. Karlseder menar att Telo-seq gör det möjligt för forskare att ställa frågor som tidigare var omöjliga att besvara. Dessa nya upptäckter kan bara vara början.

Flera organisationer stödde detta arbete, bland annat National Institute of Aging, National Cancer Institute och National Institute for General Medicine. Experter från Oxford Nanopore Technologies och UC San Diego samarbetade också i projektet.

Forskare vid Salk Institute är ivriga att se vilka upptäckter Telo-seq kommer att leda till. De tror att det kommer att hjälpa vid studier av utveckling, åldrande, stamceller och cancer. Deras resultat publiceras i Nature Communications.