La nouvelle méthode Telo-seq révolutionne la recherche sur les télomères liés au vieillissement et au cancer

Temps de lecture: 2 minutes
Par Francois Dupont
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Des chercheurs analysant des données sur les télomères à l'aide d'équipements avancés.

ParisDes chercheurs de l'Institut Salk ont mis au point un nouvel outil appelé Telo-seq. Cet outil va améliorer notre compréhension des télomères dans le cadre du vieillissement et des maladies. Les télomères sont des sections situées aux extrémités de nos chromosomes qui rétrécissent avec l'âge, ce qui peut conduire à la mort cellulaire lorsqu'ils deviennent trop courts.

Telo-seq : Une avancée significative dans l'étude des télomères

Telo-seq surpasse les anciennes méthodes en offrant des avantages notables :

  • Séquençage complet des télomères
  • Évaluation de la longueur des télomères pour chaque chromosome
  • Données de haute résolution

Jan Karlseder, le chercheur principal, explique que les méthodes précédentes ne donnaient pas de résultats clairs. Les scientifiques ne pouvaient qu'émettre des hypothèses sur l'impact des télomères sur le vieillissement et le cancer. Désormais, grâce à Telo-seq, ils peuvent directement tester leurs idées.

Karlseder et son équipe ont collaboré avec Oxford Nanopore Technologies pour utiliser le séquençage de longues lectures, combiné à de nouvelles méthodes biochimiques et bioinformatiques. La technique Telo-seq commence à l'extrémité de chaque télomère et s'étend dans la région subtélomérique. Cela permet aux scientifiques d'identifier les chromosomes et d'examiner la structure et la composition des télomères.

Des chercheurs utilisant la méthode Telo-seq ont observé que la longueur des télomères varie entre les bras des chromosomes. Ils ont également découvert que les taux de raccourcissement des télomères peuvent différer même chez une seule personne. Ce phénomène pourrait être lié à des facteurs tels que le stress et l'inflammation. Différents tissus et cellules affichent des taux de raccourcissement des télomères variés, ce qui suggère l'existence de facteurs spécifiques à chaque chromosome.

Curieux des différences de vitesse de raccourcissement des télomères entre les individus et les chromosomes, Karlseder cherche à comprendre comment cela influence le vieillissement. Selon lui, cette compréhension pourrait favoriser un vieillissement en bonne santé. Telo-seq nous aidera également à en savoir plus sur les maladies liées aux télomères.

Certaines maladies, appelées téloméropathies, surviennent lorsque les cellules souches perdent leurs télomères. Cela peut entraîner une perte de cheveux, des problèmes immunitaires ou certains cancers. La méthode Telo-seq permet aux scientifiques de déterminer si ces maladies sont héréditaires ou liées à des chromosomes spécifiques. Ces recherches pourraient aider à développer des traitements ciblés pour ces maladies.

Des télomères trop courts ou trop longs peuvent poser des problèmes. Une réparation excessive des télomères peut permettre aux cellules cancéreuses de se diviser indéfiniment. Les cellules utilisent soit l'enzyme télomérase, soit une autre méthode appelée ALT pour maintenir les télomères, et chaque méthode produit des structures différentes. Avant le Telo-seq, il était difficile de mesurer ces différences.

Tobias Schmidt, chercheur, explique que Telo-seq peut identifier si un cancer utilise la télomérase ou l'ALT. Cela est crucial car les cancers utilisant l'ALT sont souvent plus agressifs et nécessitent des traitements différents. Telo-seq pourrait rapidement aider les médecins à choisir le traitement le plus approprié pour chaque patient.

Les auteurs de l'étude estiment que Telo-seq va révolutionner la recherche sur les télomères. Selon Karlseder, cette technique permet désormais aux scientifiques de répondre à des questions auparavant inaccessibles. Ces nouvelles découvertes ne sont peut-être qu'un début.

Plusieurs organismes ont soutenu ce projet, tels que l'Institut National du Vieillissement, l'Institut National du Cancer et l'Institut National de Médecine Générale. Des experts d'Oxford Nanopore Technologies et de l'Université de Californie à San Diego ont également collaboré à cette initiative.

Les scientifiques de l'Institut Salk sont impatients de découvrir ce que le Telo-seq va révéler. Ils pensent que cette technologie aidera à étudier le développement, le vieillissement, les cellules souches et le cancer. Leurs résultats sont publiés dans Nature Communications.

L'étude est publiée ici:

http://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-48917-7

et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est

Tobias T. Schmidt, Carly Tyer, Preeyesh Rughani, Candy Haggblom, Jeffrey R. Jones, Xiaoguang Dai, Kelly A. Frazer, Fred H. Gage, Sissel Juul, Scott Hickey, Jan Karlseder. High resolution long-read telomere sequencing reveals dynamic mechanisms in aging and cancer. Nature Communications, 2024; 15 (1) DOI: 10.1038/s41467-024-48917-7
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