Uczenie głębokie przyspiesza badania serca muszek owocowych, dostarczając wiedzy o zdrowiu serca ludzi.
WarsawNaukowcy z Uniwersytetu Alabama w Birmingham dokonali znaczącego postępu w badaniach nad sercami muszek owocówek, korzystając z technologii głębokiego uczenia się oraz szybkich mikroskopów wideo. To przełomowe odkrycie może wesprzeć badania nad chorobami serca u ludzi.
Muszki owocowe, zwane również Drosophila, są istotne w badaniach nad chorobami serca u ludzi. Umożliwiają naukowcom analizowanie procesów starzenia się serca oraz chorób osłabiających jego funkcjonowanie. W przeszłości, aby ocenić pracę serca u tych owadów, badacze musieli ręcznie identyfikować momenty, kiedy serce jest najbardziej rozszerzone lub skurczone. Ten proces był czasochłonny i często obarczony niedokładnościami.
Badacze zastosowali uczenie głębokie, aby zmienić sposób, w jaki badają serca. Ta zautomatyzowana metoda umożliwia analizę kilkuset serc jednocześnie, co przyspiesza proces i zmniejsza liczbę błędów. Jak twierdzi Girish Melkani, doktor nauk, z Wydziału Patologii UAB, to podejście przynosi wiele korzyści.
- Szybsze czasy analizy
- Zredukowanie błędów ludzkich
- Możliwość analizy większej liczby obszarów serca
- Skalowalność do setek serc
Nowa metoda umożliwia naukowcom lepsze zrozumienie, jak czynniki środowiskowe i genetyczne wpływają na starzenie się serca i choroby sercowe. Melkani planuje wykorzystać tę technologię do badania problemów sercowych u zwierząt, takich jak ryby akwariowe i myszy. Technika ta mogłaby być również zastosowana do badania modeli ludzkiego serca, dostarczając cennych informacji o zdrowiu serca.
Model może bardzo dobrze przewidywać, jak starzeje się serce. Stosując metody pomiaru niepewności, można poprawić dokładność tych prognoz. Choroby serca są główną przyczyną zgonów w Stanach Zjednoczonych. Dlatego posiadanie precyzyjnych narzędzi do badania funkcji serca u zwierząt jest kluczowe.
Zespół badawczy ocenił dokładność swojego modelu, porównując działanie serca u starzejących się muszek owocowych oraz w warunkach kardiomiopatii rozstrzeniowej, którą wywołali, redukując enzym oksoglutaranu dehydrogenazy w cyklu TCA. W badaniu dotyczącym starzenia się model został wytrenowany na podstawie danych z 54 serc i zweryfikowany z użyciem zestawu danych obejmującego 177 serc. Model dokładnie odzwierciedlał oczekiwane zmiany w funkcjonowaniu serca w miarę starzenia się muszek.
Melkani wyjaśnia, że ich platforma wykorzystująca głębokie uczenie może działać na zwykłym sprzęcie konsumenckim. Stworzone oprogramowanie umożliwia obliczanie istotnych parametrów serca, takich jak średnice/okresy rozkurczowe i skurczowe, skrócenie frakcyjne, frakcja wyrzutowa, okres/rytmu serca oraz nieregularności pracy serca.
Badanie jest publikowane tutaj:
http://dx.doi.org/10.1038/s42003-024-06371-7i jego oficjalne cytowanie - w tym autorzy i czasopismo - to
Yash Melkani, Aniket Pant, Yiming Guo, Girish C. Melkani. Automated assessment of cardiac dynamics in aging and dilated cardiomyopathy Drosophila models using machine learning. Communications Biology, 2024; 7 (1) DOI: 10.1038/s42003-024-06371-7Dzisiaj · 13:54
Starożytny ser ujawnia początki kefiru na świecie
Dzisiaj · 11:53
Ostrygi znikają z wybrzeży Europy: nowe badania
Dzisiaj · 09:53
Hipokamp: klucz do zrozumienia mechanizmów pamięciowych
Dzisiaj · 04:08
Owady na czerwonym świetle: tajemnice mechanizmów hamowania
Udostępnij ten artykuł