Découvrir les interactions génétiques : une approche innovante de la causalité génomique
ParisDes chercheurs du MIT ont mis au point une nouvelle méthode pour comprendre comment les gènes interagissent entre eux en utilisant uniquement des données d'observation. Cette méthode s'attaque à un défi majeur en génomique : l'étude des interactions entre environ 20 000 gènes humains qui s'influencent de manière complexe. En évitant des expériences coûteuses et difficiles qui impliquent la manipulation directe des gènes, cette approche pourrait améliorer la capacité à prédire et modifier les comportements génétiques.
Des scientifiques s'appuient désormais sur des algorithmes sophistiqués d'apprentissage automatique pour tirer de meilleures conclusions à partir de données d'observation, autrefois jugées moins pertinentes pour analyser les relations de cause à effet.
- Identifier les modules de gènes causaux.
- Regrouper les gènes en ensembles fonctionnels.
- Reconstituer les mécanismes de cause à effet sous-jacents.
- Produire une représentation structurée de ces interactions.
Cette approche permet aux chercheurs de mieux comprendre l'interaction des gènes en se concentrant sur les relations de cause à effet. En utilisant des outils tels que la variance du Jacobien, les scientifiques peuvent déterminer quels gènes influencent les autres. Les gènes qui n'ont pas d'impact sont exclus de l'analyse, ce qui aide à créer des cartes génétiques plus structurées. Cette méthode simplifiée permet de mieux identifier les gènes impliqués dans des fonctions biologiques spécifiques, comme la croissance et la transformation des cellules.
Cet avancement arrive à point nommé. À mesure que la médecine de précision évolue, il est crucial de comprendre l'interaction des gènes afin de créer des traitements spécifiques. Cette approche peut être appliquée à une vaste quantité de données génétiques. Elle contribue également à l'amélioration des thérapies génétiques et soutient l'objectif de personnaliser la médecine selon les profils génétiques individuels.
Cette approche favorise des méthodes de recherche plus éthiques. En minimisant le besoin d'intervention, elle respecte les limites actuelles de la technologie et les normes éthiques. Les scientifiques peuvent recueillir des informations à partir des données simplement en observant, évitant ainsi les défis de l'interférence directe et économisant du temps et des ressources.
Cette approche semble prometteuse pour un usage futur en pharmacogénomique. En ciblant mieux les gènes, elle peut contribuer à développer des médicaments plus efficaces avec moins d'effets secondaires. À mesure que les chercheurs perfectionnent ces modèles, cela pourrait mener à des avancées majeures dans le traitement des maladies génétiques et améliorer les résultats pour les patients dans diverses situations médicales.
L'étude est publiée ici:
http://dx.doi.org/10.48550/arXiv.2410.23620et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est
Ryan Welch, Jiaqi Zhang, Caroline Uhler. Identifiability Guarantees for Causal Disentanglement from Purely Observational Data. Submitted to arXiv, 2024 DOI: 10.48550/arXiv.2410.23620Partager cet article