Découverte inattendue : nouvelles stratégies contre les bactéries nocives par l'équipe de l'université d'Otago

Temps de lecture: 2 minutes
Par Madelaine Dupont
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Des phages attaquent des bactéries nuisibles dans une boîte de Pétri.

ParisUne équipe de chercheurs de l'Université d'Otago, dirigée par le professeur Peter Fineran, a réalisé des découvertes cruciales sur l'interaction entre les virus qui infectent les bactéries, appelés phages, et les systèmes immunitaires bactériens. Ces recherches pourraient conduire à de nouveaux traitements qui n'utilisent pas d'antibiotiques.

Une recherche publiée dans la revue Nature explore comment les phages utilisent une protéine pour bloquer le système immunitaire CRISPR-Cas chez les bactéries. Le Dr Nils Birkholz du Département de Microbiologie et Immunologie d’Otago explique que comprendre ces interactions entre phages et bactéries pourrait permettre d'utiliser les phages pour combattre les bactéries nuisibles en santé humaine et en agriculture.

Principaux Résultats:

  • Les phages doivent déployer leurs anti-CRISPRs avec prudence.
  • Ils utilisent un domaine hélice-coude-hélice (HTH) connu pour se lier aux séquences d'ADN et pouvoir activer ou désactiver des gènes.
  • Le domaine HTH est plus polyvalent qu’on ne le pensait auparavant, capable de se lier à la fois à l’ADN et à l’ARN.
  • Cela ajoute une couche de régulation à la production des protéines anti-CRISPR.

Comprendre comment les phages surmontent les défenses bactériennes aide à sélectionner les phages appropriés pour une utilisation antimicrobienne. Cette étude démontre que les phages régulent l'expression génétique par la liaison à l'ADN et une nouvelle méthode de liaison à l'ARN.

Le professeur Fineran explique que cette découverte montre une manière plus complexe de réguler les processus. Elle modifie notre compréhension de la manière dont les phages contournent les défenses CRISPR-Cas et détruisent les bactéries. Ces connaissances pourraient être utiles dans divers domaines, y compris la santé et l'agriculture.

La recherche explore la gestion de l'expression des gènes chez les phages, y compris ceux codant pour les protéines anti-CRISPR. Cette protéine peut se lier à la fois aux séquences d'ADN et à leurs transcrits d'ARN. En raison de cette capacité de liaison multiple, la régulation de l'anti-CRISPR implique divers mécanismes.

Les domaines HTH sont présents dans de nombreuses protéines jouant un rôle dans la régulation des gènes. Leur étude remonte au début des années 1980. Cette découverte démontre que des protéines bien connues peuvent avoir des fonctions insoupçonnées. Cela pourrait modifier la manière dont les scientifiques perçoivent ces protéines essentielles.

La découverte pourrait considérablement modifier notre compréhension de la régulation des gènes. La flexibilité du domaine HTH ouvre de nouvelles perspectives sur la biologie des phages. Cela pourrait également contribuer à développer des traitements à base de phages pour remplacer les antibiotiques.

Cette étude souligne l'importance de comprendre les interactions des bactéries avec leur environnement. En approfondissant nos connaissances sur ces interactions, nous pouvons développer de nouvelles méthodes pour combattre les bactéries nuisibles, ce qui serait bénéfique en médecine et en agriculture.

L'étude est publiée ici:

http://dx.doi.org/10.1038/s41586-024-07644-1

et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est

Nils Birkholz, Kotaro Kamata, Maximilian Feussner, Max E. Wilkinson, Christian Cuba Samaniego, Angela Migur, Dari Kimanius, Marijn Ceelen, Sam C. Went, Ben Usher, Tim R. Blower, Chris M. Brown, Chase L. Beisel, Zasha Weinberg, Robert D. Fagerlund, Simon A. Jackson, Peter C. Fineran. Phage anti-CRISPR control by an RNA- and DNA-binding helix–turn–helix protein. Nature, 2024; DOI: 10.1038/s41586-024-07644-1
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