Reconstruction 3D des chromosomes d'un mammouth laineux préhistorique à partir de peau lyophilisée
ParisUne équipe internationale de scientifiques a réalisé une découverte majeure en reconstituant l'ADN et les structures chromosomiques en 3D d'un mammouth laineux vieux de 52 000 ans. Ils y sont parvenus en étudiant un échantillon de peau exceptionnellement bien préservé. Cette découverte revêt une grande importance.
- L'ADN du mammouth laineux a été conservé en état de lyophilisation.
- Première reconstruction en 3D de l'ADN ancien à cette échelle.
- Analyse d'un échantillon vieux de 52 000 ans.
- ADN extrait d'un échantillon de peau prélevé derrière l'oreille du mammouth.
L'équipe a employé une méthode appelée Hi-C pour identifier quelles parties de l'ADN interagissent entre elles à l'intérieur du noyau cellulaire. Cette technique leur a permis de créer une carte détaillée du génome du mammouth en le comparant aux génomes des éléphants actuels. Hi-C est unique car elle montre non seulement la séquence de l'ADN, mais aussi la structure 3D et l'organisation du génome dans les cellules vivantes.
L'étude a révélé que le mammouth laineux possédait 28 chromosomes, un nombre similaire à celui des éléphants asiatiques et africains modernes. Les chromosomes fossilisés montraient des structures détaillées, incluant de petites boucles qui relient les facteurs de transcription aux gènes qu'ils régulent. Ce niveau de détail nous aide à comprendre l'organisation du génome du mammouth.
Les cellules de la peau du mammouth montraient une activité génétique différente par rapport à celles de l'éléphant d'Asie, incluant des gènes qui ont pu aider à développer une fourrure laineuse et à survivre dans des climats froids. Pour la première fois, les chercheurs disposent de tissus de mammouth révélant quels gènes étaient activés ou désactivés.
Cette recherche pourrait également faciliter l’étude d’autres ADN anciens, tels que ceux des momies égyptiennes ou des spécimens de musée. Bien que des échantillons extrêmement bien conservés soient nécessaires, elle ouvre une nouvelle voie pour explorer la composition génétique des êtres anciens.
Ces découvertes sont cruciales pour les projets visant à réintroduire le mammouth laineux. Connaître les gènes actifs fournit aux scientifiques des informations précieuses sur ce qui rendait ces animaux uniques.
Cette étude revêt une grande importance. Elle introduit une nouvelle approche en paléogénomique, qui ne se contente pas d'analyser des fragments d'ADN, mais examine également la structure interne des créatures anciennes. Nous devons aller au-delà des simples séquences d'ADN pour mieux comprendre les génomes anciens. Ce n'est que le début, et je suis enthousiaste de voir les prochaines avancées.
L'étude est publiée ici:
http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.06.002et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est
Marcela Sandoval-Velasco, Olga Dudchenko, Juan Antonio Rodríguez, Cynthia Pérez Estrada, Marianne Dehasque, Claudia Fontsere, Sarah S.T. Mak, Ruqayya Khan, Vinícius G. Contessoto, Antonio B. Oliveira Junior, Achyuth Kalluchi, Bernardo J. Zubillaga Herrera, Jiyun Jeong, Renata P. Roy, Ishawnia Christopher, David Weisz, Arina D. Omer, Sanjit S. Batra, Muhammad S. Shamim, Neva C. Durand, Brendan O’Connell, Alfred L. Roca, Maksim V. Plikus, Mariya A. Kusliy, Svetlana A. Romanenko, Natalya A. Lemskaya, Natalya A. Serdyukova, Svetlana A. Modina, Polina L. Perelman, Elena A. Kizilova, Sergei I. Baiborodin, Nikolai B. Rubtsov, Gur Machol, Krisha Rath, Ragini Mahajan, Parwinder Kaur, Andreas Gnirke, Isabel Garcia-Treviño, Rob Coke, Joseph P. Flanagan, Kelcie Pletch, Aurora Ruiz-Herrera, Valerii Plotnikov, Innokentiy S. Pavlov, Naryya I. Pavlova, Albert V. Protopopov, Michele Di Pierro, Alexander S. Graphodatsky, Eric S. Lander, M. Jordan Rowley, Peter G. Wolynes, José N. Onuchic, Love Dalén, Marc A. Marti-Renom, M. Thomas P. Gilbert, Erez Lieberman Aiden. Three-dimensional genome architecture persists in a 52,000-year-old woolly mammoth skin sample. Cell, 2024; 187 (14): 3541 DOI: 10.1016/j.cell.2024.06.002Aujourd'hui · 02:10
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