新研究:冷凍乾燥した皮膚から回収した5万2千年前のマンモス染色体の3Dモデル作成

読了時間: 2 分
によって Juanita Lopez
-
凍結乾燥された皮膚サンプルを用いた3Dマンモス染色体。

Tokyo国際的な科学者のグループは、5万2000年前のマンモスのDNAと3次元染色体構造を組み合わせて重要な発見をしました。彼らは非常によく保存された皮膚サンプルからDNAを調べることでこの発見を達成しました。この発見は非常に意義深いものです。

  • マンモスのDNAは凍結乾燥された状態で保存されていました。
  • この規模の古代DNAの3D再構築は初めてです。
  • 52,000年前のサンプルが解析されました。
  • DNAはマンモスの耳の裏の皮膚サンプルから抽出されました。

チームはHi-Cという方法を用いて、細胞核内でDNAのどの部分が互いに関与しているかを調べました。この方法は、現代の象のゲノムと比較することで、マンモスのゲノムの詳細な地図を作成するのに役立ちました。Hi-CはDNA配列だけでなく、生きた細胞内でのゲノムの3D構造や配置も明らかにする点で特別です。

研究によると、マンモスの染色体数は28本で、現代のアジアゾウやアフリカゾウと似ていることが分かりました。化石化した染色体には、遺伝子を制御する転写因子とつながる小さなループを含む、詳細な構造が示されていました。このような詳細は、マンモスのゲノムがどのように配置されていたかを理解するのに役立ちます。

マンモスの皮膚細胞は、アジアゾウと比較して異なる遺伝子の活動を示していました。これには、マンモスが体毛を育て寒冷地で生き延びるのを助けた可能性のある遺伝子が含まれています。研究者たちは、初めてマンモスの組織でどの遺伝子が「オン」になり、どの遺伝子が「オフ」になっているかを確認できるようになりました。

この研究は、エジプトのミイラや博物館の標本といった他の古代のDNAの研究に役立つ可能性があります。非常に良好な保存状態のサンプルが必要ですが、古代の生物の遺伝的構成を探る新たな方法を開くものです。

これらの発見は、マンモスの復活を目指すプロジェクトにとって重要です。どの遺伝子が活性化していたかを把握することで、科学者たちはこれらの動物の特性について貴重な情報を得ることができます。

この研究は非常に重要です。新しいタイプの古代ゲノム学を紹介しており、従来の断片的なDNA分析にとどまらず、古代生物の内部構造を調査します。古代のゲノムをより深く理解するためには、単なるDNA配列を超えたアプローチが必要です。これは始まりに過ぎず、これから先に何が明らかになるのか楽しみです。

この研究はこちらに掲載されています:

http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.06.002

およびその公式引用 - 著者およびジャーナルを含む - は

Marcela Sandoval-Velasco, Olga Dudchenko, Juan Antonio Rodríguez, Cynthia Pérez Estrada, Marianne Dehasque, Claudia Fontsere, Sarah S.T. Mak, Ruqayya Khan, Vinícius G. Contessoto, Antonio B. Oliveira Junior, Achyuth Kalluchi, Bernardo J. Zubillaga Herrera, Jiyun Jeong, Renata P. Roy, Ishawnia Christopher, David Weisz, Arina D. Omer, Sanjit S. Batra, Muhammad S. Shamim, Neva C. Durand, Brendan O’Connell, Alfred L. Roca, Maksim V. Plikus, Mariya A. Kusliy, Svetlana A. Romanenko, Natalya A. Lemskaya, Natalya A. Serdyukova, Svetlana A. Modina, Polina L. Perelman, Elena A. Kizilova, Sergei I. Baiborodin, Nikolai B. Rubtsov, Gur Machol, Krisha Rath, Ragini Mahajan, Parwinder Kaur, Andreas Gnirke, Isabel Garcia-Treviño, Rob Coke, Joseph P. Flanagan, Kelcie Pletch, Aurora Ruiz-Herrera, Valerii Plotnikov, Innokentiy S. Pavlov, Naryya I. Pavlova, Albert V. Protopopov, Michele Di Pierro, Alexander S. Graphodatsky, Eric S. Lander, M. Jordan Rowley, Peter G. Wolynes, José N. Onuchic, Love Dalén, Marc A. Marti-Renom, M. Thomas P. Gilbert, Erez Lieberman Aiden. Three-dimensional genome architecture persists in a 52,000-year-old woolly mammoth skin sample. Cell, 2024; 187 (14): 3541 DOI: 10.1016/j.cell.2024.06.002
科学: 最新ニュース
次を読む:

この記事を共有

コメント (0)

コメントを投稿