L'immobilité génétique de la maladie du potiron ouvre de nouvelles perspectives de gestion
ParisLa bactérie Xanthomonas cucurbitae provoque la tache bactérienne, une maladie qui affecte les citrouilles, melons, concombres et autres plantes similaires. Elle forme de petites taches à la surface de ces fruits, les enlaidissant et réduisant la récolte. D'autres agents pathogènes nocifs peuvent ensuite s'installer et entraîner la pourriture des fruits.
Nouvelles découvertes de l'Université de l'Illinois Urbana-Champaign révèlent une faible évolution de ce pathogène. Menée par Sarah Hind, l'équipe de chercheurs a séquencé les génomes d'échantillons prélevés dans le Midwest en 2012 et 2013. Ils ont constaté que :
- Tous les génomes étaient identiques à plus de 99%.
- Un isolat du Michigan était identique à 99,9% à un échantillon prélevé à New York en 1926.
Hind, professeur en sciences des cultures à l'Illinois, a exprimé sa surprise face à la faible évolution du pathogène. Ce dernier prospère dans des conditions chaudes et humides mais reste inactif autrement. Cette stabilité pourrait faciliter la création de cultures résistantes. La faible variation du pathogène suggère que ces cultures résistantes devraient être efficaces dans le Midwest et potentiellement dans d'autres régions des États-Unis.
Actuellement, aucune culture commerciale de cucurbitacées n'est résistante. Néanmoins, Hind et son équipe ont découvert une résistance dans les variétés expérimentales de citrouilles et de courges dans une étude réalisée en 2021. Bien que d'autres variétés doivent encore être testées avant de pouvoir commencer la sélection, ces résultats sont encourageants.
Xanthomonas cucurbitae présente une faible diversité génétique, ce qui complique les stratégies de gestion de ce ravageur. Les traitements au cuivre sont généralement inefficaces contre la tache bactérienne. En comprenant mieux la génétique de ce pathogène, nous pouvons anticiper l'efficacité de nos méthodes de gestion actuelles à long terme.
Le constat que les pathogènes responsables des taches bactériennes sur les plantes n'ont pas beaucoup évolué pourrait se révéler crucial. Si les sélectionneurs parviennent à développer des plantes capables de résister à ces pathogènes, les agriculteurs pourraient subir moins de pertes de récoltes. Cela suggère également qu'il pourrait être nécessaire de modifier les méthodes agricoles actuelles pour mieux gérer les problèmes futurs liés à ces pathogènes.
La similitude génétique chez Xanthomonas cucurbitae est prometteuse pour développer des variétés de plantes résistantes et améliorer les méthodes de contrôle. Cette étude fournit des bases importantes pour de futurs travaux visant à protéger les cultures de cucurbitacées contre la tache bactérienne et ses effets néfastes.
L'étude est publiée ici:
http://dx.doi.org/10.1111/ppa.13965et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est
Rikky Rai, Kayla M. Vittore, Julius Pasion, Maria L. Malvino, Jonathan D. Mason, Qiong Liu, Salisu Sulley, Mohammad Babadoost, Julian M. Catchen, Sarah R. Hind. Comparative genomics of Xanthomonas cucurbitae isolates collected from Midwestern United States pumpkin fields. Plant Pathology, 2024; DOI: 10.1111/ppa.13965Aujourd'hui · 04:08
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