Comprendre les épidémies de grenouilles grâce à l'ADN environnemental : défis et perspectives

Temps de lecture: 2 minutes
Par Jean Rivière
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Grenouille des bois dans un étang entourée de brins d'ADN.

ParisLes chercheurs explorent comment l'ADN environnemental (ADNe) peut être utilisé pour étudier et gérer la faune, en particulier les grenouilles des bois et leur risque de flambées de ranavirus. Cette technique repose sur le matériel génétique que les animaux laissent derrière eux pour identifier les espèces et comprendre l'évolution de leurs populations. Cependant, il reste difficile de mesurer précisément la taille des populations à l'aide de l'ADNe.

Principaux défis de l'ADNe :

Les défis liés à l'ADNe incluent l'impossibilité de déterminer avec exactitude les tailles de population, particulièrement pour les petits groupes, l'influence des facteurs environnementaux sur la concentration de l'ADNe, et la variation d'échantillon à échantillon qui affecte la fiabilité des résultats.

Tracy Rittenhouse et Meghan Parsley, accompagnées de leur équipe, ont mené une étude sur les épidémies de ranavirus chez les grenouilles des bois. Elles ont utilisé l'ADNe pour examiner comment des facteurs climatiques comme la température et la salinité influencent ces épidémies. Leur recherche a consisté à recréer des conditions environnementales plus extrêmes pour voir comment cela affecte les niveaux d'ADNe et la propagation de la maladie. L'étude a mis en lumière les difficultés de relier l'ADNe au nombre de grenouilles, car ces niveaux peuvent changer selon les conditions environnementales.

Bien que la recherche sur l'ADN environnemental ait beaucoup progressé, déterminer la quantité précise d'eADN reste compliqué. Nous pouvons clairement identifier la présence d'une espèce, mais en estimer le nombre exact est plus difficile. L'eADN est utile pour déceler de grandes variations, comme la présence de milliers ou de seulement quelques individus. Cependant, pour détecter de petites fluctuations dans la taille des populations, nous devons encore perfectionner cette méthode.

Améliorer la collecte d'échantillons pourrait devenir crucial à l'avenir. Nous devrions chercher à développer des méthodes pour rendre les échantillons plus cohérents et fiables. Il sera également essentiel d'approfondir la compréhension des données en utilisant des indices environnementaux. En outre, mieux connaître le processus de dégradation de l'ADN environnemental au fil du temps aidera les chercheurs à affiner leur travail.

Utiliser l'ADNe pour la gestion et la conservation de la faune présente un grand potentiel, mais davantage de recherches sont nécessaires pour résoudre les problèmes actuels. À mesure que les scientifiques comprennent mieux comment les facteurs environnementaux influencent les niveaux d'ADNe, cette compréhension sera très précieuse pour la conservation. Cela aidera à prendre des décisions de gestion visant à protéger des espèces en danger, comme la grenouille des bois, contre des maladies telles que le ranavirus.

L'étude est publiée ici:

http://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-66732-4

et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est

Meghan B. Parsley, Erica J. Crespi, Tracy A. G. Rittenhouse, Jesse L. Brunner, Caren S. Goldberg. Environmental DNA concentrations vary greatly across productive and degradative conditions, with implications for the precision of population estimates. Scientific Reports, 2024; 14 (1) DOI: 10.1038/s41598-024-66732-4
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