Les bactéries comammox : une révolution pour réduire les émissions de gaz à effet de serre agricoles

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Par Francois Dupont
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Bactéries Comammox dans les sols agricoles.

ParisUn groupe de chercheurs internationaux a récemment découvert que les bactéries comammox, identifiées en 2015, peuvent utiliser la guanidine comme seule source d'énergie et d'azote. Cette découverte est cruciale car elle facilite la culture de ces bactéries, qui émettent très peu de protoxyde d'azote, un puissant gaz à effet de serre. L'utilisation des bactéries comammox en agriculture pourrait considérablement réduire les émissions.

La nitrification joue un rôle crucial dans le cycle mondial de l'azote en transformant l'ammoniac en nitrate, utilisable par les plantes. Malheureusement, cette transformation libère souvent du protoxyde d'azote, nuisible pour l'environnement. Toutefois, les bactéries Comammox produisent beaucoup moins de protoxyde d'azote que les nitrifiants traditionnels, ce qui les rend plus respectueuses de l'environnement.

Voici quelques points clés à prendre en compte :

Les bactéries comammox utilisent le guanidine plus efficacement que d'autres sources d'azote. Elles se trouvent dans divers environnements, tels que les stations d'épuration et les sols agricoles. L'ajout de guanidine aux engrais pourrait favoriser la croissance de ces bactéries dans les sols.

Des chercheurs du Centre de Microbiologie et de Science des Systèmes Environnementaux (CeMESS) de l'Université de Vienne ont découvert une méthode pour améliorer l'agriculture. En ajoutant de la guanidine aux engrais, les agriculteurs peuvent favoriser la croissance des bactéries comammox. Cela réduit les émissions de protoxyde d'azote et permet aux cultures d'utiliser l'azote de manière plus efficace. Avec l'augmentation des engrais synthétiques et la nécessité de réduire les gaz à effet de serre, cette découverte revêt une importance cruciale.

L'étude éclaire également le rôle de la guanidine dans l'environnement. La guanidine, souvent connue comme un sous-produit chez les microorganismes et les plantes, a une présence et un traitement environnementaux mal définis. Cette recherche précise sa présence dans l'urine humaine, les déchets animaux, et les sols.

Une nouvelle enzyme découverte chez les bactéries comammox transforme très efficacement la guanidine en ammonium. Les scientifiques ont identifié à la fois le transporteur et l'enzyme, ouvrant de nouvelles perspectives pour étudier comment ces éléments peuvent être utilisés.

L'équipe de Vienne travaille à isoler davantage de types de bactéries comammox provenant de l'environnement. Actuellement, ils ne disposent que d'un seul type à l'état pur. Disposer de plus de variétés serait bénéfique pour l'agriculture et le traitement des eaux usées.

L'étude est publiée ici:

http://dx.doi.org/10.1038/s41586-024-07832-z

et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est

Marton Palatinszky, Craig W. Herbold, Christopher J. Sedlacek, Dominic Pühringer, Katharina Kitzinger, Andrew T. Giguere, Kenneth Wasmund, Per H. Nielsen, Morten K. D. Dueholm, Nico Jehmlich, Richard Gruseck, Anton Legin, Julius Kostan, Nesrete Krasnici, Claudia Schreiner, Johanna Palmetzhofer, Thilo Hofmann, Michael Zumstein, Kristina Djinović-Carugo, Holger Daims, Michael Wagner. Growth of complete ammonia oxidizers on guanidine. Nature, 2024; DOI: 10.1038/s41586-024-07832-z
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