Nowe badanie: zastosowanie danych i symulacji molekularnych do przyspieszenia odkrywania leków.
WarsawNaukowcy z Uniwersytetu Medycznego w Cincinnati oraz Szpitala Dziecięcego w Cincinnati opracowali nową metodę, która przyspiesza i zwiększa dokładność odkrywania leków. Opublikowana 30 sierpnia w czasopiśmie Science Advances, ich metoda łączy dane z Biblioteki Zintegrowanych Sieciowych Sygnatur Komórkowych (LINCS) z symulacjami dokowania molekularnego. Dzięki tej nowej technice czas potrzebny na screening i ocenę potencjalnych związków terapeutycznych skraca się z miesięcy do zaledwie kilku minut.
Metoda ta charakteryzuje się kilkoma kluczowymi cechami: wykorzystuje bazę danych LINCS do jednoczesnego przeszukiwania wielu małych cząsteczek, przeprowadza symulacje dokowania, aby sprawdzić, jak te cząsteczki oddziałują z określonymi celami białkowymi, oraz oferuje szybsze przeszukiwanie, co pozwala na bardziej efektywne i dokładne identyfikowanie potencjalnie skutecznych związków.
Alex Thorman, doktor nauk, współautor badania, podkreślił znaczenie tej nowej metody. Może ona znacznie przyspieszyć proces odkrywania nowych leków, co jest kluczowe podczas sytuacji kryzysowych zdrowotnych, takich jak pandemia COVID-19. Zazwyczaj znalezienie i zatwierdzenie nowych leków zajmuje lata. Dzięki tej nowej metodzie, ten proces mógłby zostać skrócony do zaledwie kilku miesięcy, co stanowi istotną poprawę.
Wykorzystanie bazy danych LINCS oraz symulacji molekularnych odgrywa kluczową rolę w medycynie precyzyjnej. Podejście to ułatwia opracowywanie terapii dostosowanych do unikalnego kodu genetycznego, środowiska i stylu życia danej osoby. Dzięki lepszemu rozpoznaniu, które związki działają najskuteczniej, leczenie może być bardziej precyzyjnie dopasowane, co prowadzi do lepszych wyników zdrowotnych pacjentów.
Ta metoda może przyczynić się do opracowania terapii dla chorób, na które obecnie nie ma lekarstw, takich jak niektóre nowotwory. Szczegółowe dane zawarte w bazie LINCS, w połączeniu z precyzyjnymi symulacjami molekularnymi, mogą znaleźć obiecujących kandydatów na leki, których nie wykryły starsze, wolniejsze metody.
Jim Reigle, PhD, i Somchai Chutipongtanate, PhD, główni autorzy pracy, współpracowali z doświadczonymi naukowcami Jarekiem Mellerem, PhD, oraz Andrewem Herrem, PhD. Ich zróżnicowana wiedza wzmacnia badanie. Współpraca ta podkreśla znaczenie łączenia biostatystyki, informatyki zdrowotnej, immunobiologii i nauk o zdrowiu publicznym, aby skutecznie rozwiązywać trudne problemy medyczne.
Różnorodne fundusze, w tym z Krajowych Instytutów Zdrowia oraz Departamentu ds. Weteranów, potwierdzają, że badania te są powszechnie uznawane ze względu na ich potencjalny wpływ. Dodatkowo, złożenie trzech amerykańskich patentów związanych z tą pracą wskazuje na duże zainteresowanie komercyjne oraz potencjalne przyszłe zastosowania w rozwoju leków.
Łączenie ogromnych ilości danych z drobiazgowymi symulacjami molekularnymi stanowi istotny krok naprzód w odkrywaniu nowych leków. Ta nowa metoda ma potencjał przyspieszenia oraz zwiększenia precyzji całego procesu, co poprawi przyszłe terapie i da nadzieję pacjentom cierpiącym na choroby, dla których obecnie nie ma lekarstwa.
Badanie jest publikowane tutaj:
http://dx.doi.org/10.1126/sciadv.adj3010i jego oficjalne cytowanie - w tym autorzy i czasopismo - to
Alexander W. Thorman, James Reigle, Somchai Chutipongtanate, Juechen Yang, Behrouz Shamsaei, Marcin Pilarczyk, Mehdi Fazel-Najafabadi, Rafal Adamczak, Michal Kouril, Surbhi Bhatnagar, Sarah Hummel, Wen Niu, Ardythe L. Morrow, Maria F. Czyzyk-Krzeska, Robert McCullumsmith, William Seibel, Nicolas Nassar, Yi Zheng, David A. Hildeman, Mario Medvedovic, Andrew B. Herr, Jarek Meller. Accelerating drug discovery and repurposing by combining transcriptional signature connectivity with docking. Science Advances, 2024; 10 (35) DOI: 10.1126/sciadv.adj3010Udostępnij ten artykuł