Ny studie: utnyttja data och molekylära simuleringar för att påskynda läkemedelsupptäckten
StockholmForskare vid University of Cincinnati College of Medicine och Cincinnati Children's Hospital har utvecklat en ny metod för att göra upptäckten av läkemedel snabbare och mer exakt. Deras teknik, som publicerades den 30 augusti i Science Advances, kombinerar data från Library of Integrated Network-based Cellular Signatures (LINCS) med specifika molekylära dockningssimuleringar. Denna nya metod förkortar tiden det tar att undersöka och utvärdera potentiella terapeutiska föreningar från månader till bara några minuter.
Denna metod har flera viktiga egenskaper: den använder LINCS-databasen för att samtidigt screena många små molekyler, genomför dockningssimuleringar för att bedöma hur dessa molekyler interagerar med specifika proteintargets och erbjuder snabbare screening som hjälper till att identifiera potentiellt effektiva föreningar mer effektivt och noggrant.
Alex Thorman, PhD, som var medförfattare till studien, betonade hur betydelsefull denna nya metod är. Den kan snabba upp processen att hitta nya läkemedel, vilket är avgörande under hälsoförhållanden som COVID-19-pandemin. Vanligtvis tar det år att hitta och godkänna nya läkemedel. Denna nya metod kan förkorta den processen till bara några månader, vilket är en stor förbättring.
Att använda LINCS-databasen och molekylära simuleringar är avgörande för precisionsmedicin. Denna metod underlättar utvecklingen av behandlingar anpassade till en individs unika genetiska sammansättning, miljö och livsstil. Genom att bättre identifiera vilka läkemedel som fungerar bäst kan behandlingarna skräddarsys mer exakt, vilket leder till förbättrade patientresultat.
Denna metod kan bidra till att utveckla behandlingar för sjukdomar som för närvarande saknar botemedel, till exempel vissa typer av cancer. Den detaljerade informationen i LINCS-databasen, tillsammans med exakta molekylära simuleringar, kan identifiera lovande läkemedelskandidater som tidigare har förbisetts av äldre och långsammare metoder.
Jim Reigle, PhD, och Somchai Chutipongtanate, PhD, som är huvudförfattarna, arbetade tillsammans med seniora författarna Jarek Meller, PhD, och Andrew Herr, PhD. Deras olika expertområden förstärker studien. Det här samarbetet visar vikten av att kombinera biostatistik, hälsoinformatik, immunobiologi och folkhälsovetenskap för att lösa svåra medicinska problem.
Olika bidrag, inklusive från National Institutes of Health och Department of Veterans Affairs, visar att denna forskning erkänns brett för sin potentiella påverkan. Dessutom visar ansökan om tre amerikanska patent relaterade till detta arbete på ett starkt kommersiellt intresse och möjliga framtida användningsområden inom läkemedelsutveckling.
Att kombinera stora mängder data med detaljerade molekylära simuleringar är ett stort framsteg i jakten på nya läkemedel. Denna nya metod lovar att påskynda och förfina processen, vilket förbättrar framtida behandlingar och ger hopp till patienter med sjukdomar som för närvarande saknar botemedel.
Studien publiceras här:
http://dx.doi.org/10.1126/sciadv.adj3010och dess officiella citering - inklusive författare och tidskrift - är
Alexander W. Thorman, James Reigle, Somchai Chutipongtanate, Juechen Yang, Behrouz Shamsaei, Marcin Pilarczyk, Mehdi Fazel-Najafabadi, Rafal Adamczak, Michal Kouril, Surbhi Bhatnagar, Sarah Hummel, Wen Niu, Ardythe L. Morrow, Maria F. Czyzyk-Krzeska, Robert McCullumsmith, William Seibel, Nicolas Nassar, Yi Zheng, David A. Hildeman, Mario Medvedovic, Andrew B. Herr, Jarek Meller. Accelerating drug discovery and repurposing by combining transcriptional signature connectivity with docking. Science Advances, 2024; 10 (35) DOI: 10.1126/sciadv.adj3010Dela den här artikeln