Genomika odkrywa nowe punkty startowe w tysiącach genów soi i ich złożoności
WarsawPostępy w badaniach genomowych znacząco przyczyniły się do lepszego zrozumienia genetyki soi. Naukowcy niedawno odkryli różne punkty początkowe dla aktywności genów w wielu genach soi. To nowe odkrycie rozszerza naszą dotychczasową wiedzę i pokazuje, że ekspresja genów jest bardziej złożona, niż przypuszczaliśmy.
Korzystając z najnowszej metody STRIPE-seq, zespół badaczy pod kierownictwem Jianxina Ma precyzyjnie określił, gdzie geny zaczynają funkcjonować w genomie soi. To osiągnięcie pozwala naukowcom lepiej zrozumieć, jak działają geny, co może wywrzeć znaczący wpływ na rolnictwo i biotechnologię. Oto kilka kluczowych punktów:
Identyfikacja alternatywnych miejsc inicjacji transkrypcji w ponad 40 000 genach soi. Odkrycie, że mniej niż 3% przewidywanych miejsc inicjacji transkrypcji było wcześniej dokładnych. Badanie nowych miejsc transkrypcji w brodawkach korzeniowych, które są kluczowe dla wiązania azotu.
Naukowcy odkryli, że soja potrafi korzystać z różnych punktów startowych w obrębie tego samego genu, aby wytwarzać różnorodne białka. To odkrycie zmienia nasze rozumienie ekspresji genów i dodaje złożoności do sposobu, w jaki geny są regulowane. Takie wnioski są istotne dla takich dziedzin jak biotechnologia rolnicza i hodowla roślin.
Rośliny, takie jak soja, mogą zaczynać syntezę białek na różne sposoby, co pozwala im wytwarzać różnorodne białka bez potrzeby posiadania większej liczby genów. Ta zdolność daje im przewagę w adaptacji do różnych środowisk. Lepsze zrozumienie tego procesu może pomóc w tworzeniu upraw, które lepiej radzą sobie w trudnych warunkach.
Zespół badawczy dąży do dodania tych danych do SoyBase, internetowej bazy danych służącej do wymiany informacji. Celem tego działania jest ułatwienie dostępu do danych naukowcom na całym świecie. Rozszerzając naszą wiedzę na temat miejsc, w których rozpoczyna się transkrypcja, możemy lepiej zrozumieć, jak regulowane są geny i jak przejawiają się cechy w uprawach.
Naukowcy coraz lepiej poznają genom soi, co pokazuje, jak genetyka roślin może się zmieniać. Poprzez zrozumienie, jak zaczynają działać geny, możemy ulepszać uprawy soi i potencjalnie wpływać na rolnictwo na całym świecie. Odkrycie mechanizmów działania DNA może pomóc rozwiązać istotne problemy związane z zaopatrzeniem w żywność.
Badanie jest publikowane tutaj:
http://dx.doi.org/10.1093/plcell/koae288i jego oficjalne cytowanie - w tym autorzy i czasopismo - to
Xutong Wang, Jingbo Duan, Chancelor B Clark, Wanjie Feng, Jianxin Ma. Noncanonical transcription initiation is primarily tissue specific and epigenetically tuned in paleopolyploid plants. The Plant Cell, 2024; DOI: 10.1093/plcell/koae288Udostępnij ten artykuł