DDM1タンパク質がアラビドプシスでの転移可能な遺伝子制御を解明:遺伝病理解の新たな知見

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によって Juanita Lopez
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DDM1タンパク質が遺伝子制御を行っていることが特記されたシロイヌナズナ。

Tokyo東京大学の研究者たちが、長谷部昭久教授と滝沢良正教授の指導のもと、シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)における「ジャンピング遺伝子」の制御メカニズムに関する新しい知見を明らかにしました。彼らは、DDM1(Decreased in DNA Methylation 1)というタンパク質の役割を発見しました。このタンパク質は、トランスポゾンと呼ばれる「ジャンピング遺伝子」の活動を抑制するために不可欠であり、それらが抑えやすくなるように働きます。

研究の要点は以下の通りです。

  • DDM1は、トランスポゾンに転写を抑制する化学的なマークを付けやすくします。
  • トランスポゾンは、ゲノム内を移動できる遺伝子です。
  • DDM1はヌクレオソーム内のDNAに結合し、それを開きます。
  • この結合部位の柔軟性により、化学的なマークが付けられ、転写が停止します。

DDM1は、DNAの特定の部分であるトランスポゾンに化学的な印を加えることで、それを不活性化する役割を果たしています。このメカニズムは、以前は完全には解明されていませんでした。これは、トランスポゾンが通常、ヌクレオソームと呼ばれる構造内に存在するためです。ヌクレオソームは、DNAがヒストンというタンパク質に巻きついている構造で、この巻きつきによって、細胞がトランスポゾンにアクセスして抑制を加えることが難しくなります。

クライオ電子顕微鏡という詳細なイメージング手法を用いて、研究者たちはヌクレオソーム内のDDM1とDNAの構造を観察しました。オサカベ氏は、最も興奮した発見のひとつとして、DDM1がヌクレオソームとどのように相互作用するかを確認できたことを挙げました。この観察は、DDM1がどの部分に結合するかを明確に示し、化学的変化を可能にするためにヌクレオソームを柔軟にしていることが重要でした。

この発見は、基本的な生物学的プロセスを明らかにし、実用的な用途を持つため重要です。DDM1を理解することで、人間における突然変異によって引き起こされる遺伝病に対処することができます。DDM1の人間版であるHELLSは、似たような働きをします。この研究は、将来的に遺伝性疾患の新しい治療法の開発につながる可能性があります。

この知識は農業やバイオテクノロジー分野で役立ちます。科学者たちは、植物のDNAの働きを調整することで、作物の生産量を増やしたり、新たなバイオテクノロジーの利用法を生み出すことが可能になるかもしれません。この研究から学ぶことで、生物がどのようにDNAを扱っているかがわかり、様々な分野での進歩につながります。

これらの微細な構造を理解し、その詳細を読み解くことは、生物学的システムがいかに複雑で正確であるかを示しています。これらの発見が遺伝学や他の分野でどのような新しい機会を生み出すのかを考えることは、非常に興奮をもたらします。

この研究はこちらに掲載されています:

http://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-49465-w

およびその公式引用 - 著者およびジャーナルを含む - は

Akihisa Osakabe, Yoshimasa Takizawa, Naoki Horikoshi, Suguru Hatazawa, Lumi Negishi, Shoko Sato, Frédéric Berger, Tetsuji Kakutani, Hitoshi Kurumizaka. Molecular and structural basis of the chromatin remodeling activity by Arabidopsis DDM1. Nature Communications, 2024; 15 (1) DOI: 10.1038/s41467-024-49465-w
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