Méthode révolutionnaire pour éditer simultanément plusieurs points du génome en une seule étape

Temps de lecture: 2 minutes
Par Madelaine Dupont
- dans
Brin d'ADN avec plusieurs points d'édition mis en évidence.

ParisLes scientifiques des Gladstone Institutes ont mis au point une nouvelle méthode permettant de réaliser plusieurs modifications précises du génome simultanément. Cette avancée révolutionnaire va considérablement améliorer nos moyens d'étude des maladies et le développement de nouveaux traitements. Les chercheurs ont utilisé des molécules appelées retrons pour créer un outil capable de modifier efficacement l'ADN dans les bactéries, les levures et les cellules humaines. Cette méthode novatrice permet de surmonter les limites des techniques actuelles d'édition de génome, qui ne permettent des modifications qu'en un seul endroit à la fois.

Voici ce qui est essentiel :

  • Nouvelle méthode permettant de réaliser plusieurs modifications génomiques en une seule étape
  • Utilise des retrons pour modifier l'ADN de manière efficace
  • Fonctionne dans les bactéries, les levures et les cellules humaines

L'édition génomique est cruciale pour comprendre les maladies et développer des traitements pour corriger les altérations génétiques préjudiciables. Les méthodes actuelles sont lentes car elles ne peuvent modifier qu'une seule partie du génome à la fois. Les chercheurs doivent effectuer chaque modification individuellement, ce qui nécessite beaucoup de travail.

Seth Shipman, chercheur aux Gladstone Institutes, visait à faire progresser les technologies génomiques. En 2022, son équipe a combiné les retrons avec CRISPR-Cas9 pour développer une méthode permettant d'éditer rapidement les cellules humaines. Cependant, ils se heurtaient encore à un défi majeur : l'édition simultanée de plusieurs régions du génome n'était pas encore réalisable.

Alejandro González-Delgado, chercheur postdoctoral dans le laboratoire de Shipman et co-auteur de l'étude, explique que l'ancienne méthode nécessitait de faire plusieurs modifications successives, en réutilisant les cellules modifiées à chaque étape. Ce processus demandait beaucoup de temps et d'efforts. Grâce aux multitrons, ils peuvent désormais effectuer plusieurs modifications simultanément, simplifiant ainsi grandement la procédure.

Les multitrons peuvent supprimer de vastes portions du génome, en réalisant des suppressions progressives pour éliminer les parties centrales d'une région ciblée jusqu'à la disparition complète du segment.

L’équipe a démontré comment leurs méthodes peuvent enregistrer des événements moléculaires et améliorer l’ingénierie métabolique. Par le passé, les retrons permettaient de suivre les changements au sein d’une cellule. Désormais, grâce aux multitrons, ces enregistrements sont plus précis et détaillés. González-Delgado affirme que cette technologie pourrait être utilisée dans l’intestin pour surveiller des situations comme l’inflammation.

Des chercheurs ont utilisé des outils spécialisés pour modifier plusieurs gènes dans une voie métabolique. Cela leur a permis de tripler la production de lycopène, un puissant antioxydant. Cette méthode montre un potentiel considérable pour des applications industrielles et médicales.

Shipman et son équipe ont notablement amélioré la technologie d'édition génomique. Leur méthode permet aux scientifiques d'effectuer de nombreuses modifications précises en même temps, accélérant ainsi les recherches et facilitant l'étude et le traitement des maladies génétiques complexes.

L'étude est publiée ici:

http://dx.doi.org/10.1038/s41589-024-01665-7

et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est

Alejandro González-Delgado, Santiago C. Lopez, Matías Rojas-Montero, Chloe B. Fishman, Seth L. Shipman. Simultaneous multi-site editing of individual genomes using retron arrays. Nature Chemical Biology, 2024; DOI: 10.1038/s41589-024-01665-7
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