Nouvelles avenues de l'innovation thérapeutique

Temps de lecture: 2 minutes
Par Pierre Martin
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Protéines interagissant avec la visualisation des voies générées par l'IA.

ParisJack Cheng et son équipe de l'Université du Missouri ont mis au point Cryo2Struct, un programme d'intelligence artificielle qui aide à comprendre les interactions entre les protéines. Cela revêt une importance cruciale pour le traitement et la prévention des maladies. Cryo2Struct utilise la microscopie cryo- électronique pour créer automatiquement des modèles précis des structures protéiques, offrant ainsi une précision accrue par rapport aux méthodes antérieures.

  • Amélioration de la compréhension des interactions protéiques
  • Génération automatique de modèles protéiques en 3D
  • Ouvre la voie à des avancées dans la conception de médicaments

Le travail de Cheng va au-delà de la simple prédiction des structures protéiques. Les protéines sont des biomolécules essentielles qui ne fonctionnent pas seules. Elles se regroupent en ensembles complexes pour accomplir des tâches biologiques. Comprendre ces tâches a longtemps été difficile en raison de l'impact du repliement des protéines sur leur fonctionnement. L'apprentissage profond a apporté des avancées dans ce domaine, et Cheng a été un pionnier. Son travail a inspiré des modèles comme AlphaFold de Google. Cependant, comprendre comment les protéines interagissent reste un défi pour mieux cerner les maladies et développer des traitements.

Cryo2Struct est un outil révolutionnaire qui analyse les images de cryo-EM pour révéler la structure atomique des complexes protéiques sans nécessiter d'informations préalables. Cette cartographie précise permet aux scientifiques de développer de nouvelles méthodes pour traiter les maladies. En saisissant la structure des complexes protéiques, les chercheurs peuvent concevoir des médicaments pour corriger ou ajuster les activités protéiques anormales.

Déverrouiller le Développement Pharmaceutique

Dans le domaine de la recherche médicale, la création de nouveaux traitements avance grâce à des innovations et des collaborations inédites. De la phase de découverte des médicaments à celle des essais cliniques, chaque étape est cruciale pour apporter de plus en plus rapidement des solutions aux patients. Les avancées technologiques et scientifiques jouent un rôle clé en accélérant ce processus, rendant l'accès aux nouvelles thérapies plus efficace et sécurisé que jamais.

L'équipe de recherche de Cheng a utilisé des modèles de diffusion pour étudier comment les molécules se transforment de formes aléatoires en structures spécifiques. Leur objectif est d'améliorer l'efficacité des médicaments en modifiant les modèles moléculaires pour optimiser leur liaison et leur interaction avec les protéines. Par exemple, si un médicament fonctionne partiellement pour une maladie, l'IA peut aider à l'ajuster pour être plus efficace chez certains patients. Le travail de Cheng met en lumière une tendance vers la médecine personnalisée, où les traitements sont adaptés en fonction du profil génétique et moléculaire unique d'une personne.

Le travail de Cheng à l'Université du Missouri, tant au sein du NextGen Precision Health qu'à la Faculté d'ingénierie, est crucial pour rassembler diverses expertises. Ces collaborations exploitent les technologies et équipements les plus avancés pour progresser en santé de précision, qui vise des traitements adaptés à chaque individu. Cela pourrait notablement améliorer l'efficacité et la précision des soins de santé. L'objectif est à la fois de mieux comprendre les maladies et d'améliorer les méthodes de traitement pour qu'elles soient plus efficaces.

L'étude est publiée ici:

http://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-49647-6

et sa citation officielle - y compris les auteurs et la revue - est

Nabin Giri, Jianlin Cheng. De novo atomic protein structure modeling for cryoEM density maps using 3D transformer and HMM. Nature Communications, 2024; 15 (1) DOI: 10.1038/s41467-024-49647-6
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